mNGS技术和血清G试验在判断耶氏肺孢子菌感染与定植中的价值及二者相关性研究
洗液,肺泡,计数,1资料与方法,2结果,3讨论
张彩霞,刘新年,杜川,王新卫耶氏肺孢子菌肺炎(Pneumocystis jirovecii pneumonia,PJP)是由耶氏肺孢子菌(Pneumocystis jirovecii,PJ)引起的人类呼吸系统机会性感染,多发生于免疫功能低下者。由于PJ不能在体外培养基生长,故目前确诊PJP仍是通过染色镜检发现呼吸道标本特征性的包囊或滋养体为主,但传统的染色方法灵敏度不高,使得大部分PJP患者不能得以准确、快速确诊[1]。因此,还需结合临床表现以及其他检测方法。目前,多项研究显示血清1,3-β-D葡聚糖定量检测(G试验)[2-6]可辅助诊断PJP,且数值的高低可鉴别PJ定植和感染,数值越高,感染可能性越大,但鉴别二者的截断值尚无定论。另外,随着宏基因组二代测序(metagenomic next generation sequencing,mNGS)技术兴起,由于该技术具有广覆盖、迅速高敏、无偏倚性的特点,已被广泛应用于疑难、危重、特殊病原体检测[7-9]及感染性疾病诊断中[10-12],因此提高了PJP的诊断率。尽管mNGS应用前景广阔,但仍存在无法明确背景菌、污染菌、定植菌、致病菌等情况,尤其PJ可以共生或以正常菌群的形式定植于人体呼吸道,故当mNGS检出PJ序列时,那么其是定植还是感染呢?其有无合适的截断值予以判断呢?本研究拟通过比较PJ感染者与定植者的临床特点以及血清G试验、肺泡灌洗液mNGS序列数的差异,从而探讨肺泡灌洗液mNGS技术、血清G试验在判断PJ感染与定植中的价值以及二者相关性。
1 资料与方法
1.1 一般资料 对2018年9月至2022年5月在江汉大学附属湖北省第三人民医院收治住院治疗且行肺泡灌洗液mNGS技术检出PJ序列数的40例肺部感染患者的病例资料进行回顾性分析。根据mNGS检出PJ是否抗PJ治疗分为两组:PJ感染组(mNGS检出PJ,抗PJ治疗有效者)21例,PJ定植组(mNGS检出PJ,未抗PJ治疗好转出院者)19例。PJP诊断标准:(1)临床表现为咳嗽、发热、呼吸困难、进行性缺氧等;(2)影像学表现为多发性结节、多发斑片影或实变影、磨玻璃样改变或肺间质弥漫浸润病变等;(3)mNGS检出PJ序列;(4)由两位及以上具有高级职称且经验丰富的医生共同诊断;(5)抗PJ治疗有效。两组排除标准:(1)年龄<18岁;(2)无肺部感染及病原学证据;(3)mNGS前行经验性抗PJ治疗者;(4)肺部真菌感染者,严重心脏疾病及严重心律失常者,近1个月发生心脑血管事件者,严重精神心理性疾病及无行为能力不能配合完成肺泡灌洗液mNGS检查者等;(5)临床资料不完整;(6)后期随访不符合诊断者 ......
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