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编号:234938
常染色体显性多囊肾病(ADPKD)相关潜在基因特征的生物信息学分析
http://www.100md.com 2022年11月21日 按摩与康复医学 2022年第23期
通路,1数据采集和方法,2结果与分析,3讨论
     韩君

    (北京康仁堂药业有限公司,北京 101301)

    常染色体显性多囊肾病(ADPKD)是最常见的单基因肾脏疾病[1]。大多数ADPKD患者出生时是健康的,但双肾的渐进性囊性转化会诱发肾功能的持续下降,导致肾衰竭,瞬时受体电位通道相互作用多囊蛋白1(PKD1)和瞬时受体电位通道相互作用多囊蛋白2(PKD2)这两个基因的突变导致ADP‐KD,这些基因的蛋白产物多囊素-1(PC-1)和瞬时受体电位通道多囊素-2(TRPP2)形成一个大分子复合物发挥作用,调节多种信号通路以维持正常的肾小管结构和功能[2-3]。Song X等[4]阐明了调节ADPKD中肾囊肿生长的分子途径,Friedrich S等[5]对常染色体显性多囊肾病上皮细胞进行了转录组分析,数据表明包括6个重复的C3、FSTL1、PCOLCE、PCSK9、SPP1和ZFP37和8个 新 发 现 的CD34、CDH2、CSF2RA、DLX5、HOXC9、PIK3R1、PLCB1和TLR6基因可以为ADPKD的后续功能研究选择目标,Menezes LF等[6]发现常染色体显性多囊肾病Pkd1-小鼠模型的网络分析确定HNF4α为疾病调节因子,Zhang C等[7]发现细胞周期蛋白依赖性激酶1的活性是多囊肾病中囊肿生长的驱动力,Pandey P等[8]用系统生物学方法确定多囊肾病进展过程中的转录组重编程和候选microRNA目标,Malas TB等[9]多囊肾病表达谱的Meta分析确定了损伤修复过程的强烈参与,Kunnen SJ等[10]剪切应力处理的Pkd1(-/-)细胞和前囊肿肾的比较转录组学揭示了参与早期多囊肾病的途径,尽管已经发现了许多潜在的生物标记物。然而,ADPKD发展的分子机制还没有被充分探索。

    1 数据采集和方法

    1.1 数据预处理和DEGs鉴定 本实验通过GEO数据库中的GSE7869数据集进行分析 ......

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