周晨慧，徐道华，汪肖云，陈文君，李 珊

    (广东医学院护理学院，广东东莞523808)

    华支睾吸虫硫氧还蛋白跨膜蛋白基因的生物信息学分析

    周晨慧，徐道华，汪肖云，陈文君，李 珊

    (广东医学院护理学院，广东东莞523808)

    目的对华支睾吸虫硫氧还蛋白跨膜蛋白(Cs TMX)基因进行生物信息学分析。方法利用生物信息学方法(InterProScan、SignalP、TMHMM和SWISS-MODEL等相关软件)对Cs TMX基因及相应氨基酸序列的同源性、理化性质、保守结构域、信号肽、亲水性/疏水性、三级结构进行预测分析。结果Cs TMX基因的开放阅读框(ORF)包含414 bp，编码137个氨基酸，理论分子质量为16.04×103，等电点为5.16。TMHMM和SignalP3.0分析结果显示Cs TMX含信号肽，其在第19~20位氨基酸之间有1个切割位点；InterProScan和SWISS-MODEL分析结果显示，TMX特征性结构域位于第21~ 27位氨基酸之间，并且具有高度保守的CPAC基因序列。结论利用生物信息学知识和各种分析软件对Cs TMX所编码的cDNA序列及理论蛋白质的理化性质、结构和功能域等进行预测和分析，能够为开展Cs TMX的表达及其功能研究提供理论依据。

    华支睾吸虫病； 硫氧还蛋白质类； 膜蛋白质类； 基因； 计算生物学

    华支睾吸虫病是由华支睾吸虫感染引起的一种食源性人兽共患寄生虫病，是当前我国最严重的食源性寄生虫病之一。华支睾吸虫囊蚴在十二指肠脱囊移入人或动物肝胆管中寄生，虫体摄食和迁移产生的机械损伤及其分泌代谢产物引起的化学损伤，均可引起宿主一系列肝胆管组织的病理改变。患者在急性期可表现为胆囊炎、胆管炎、黄疸型肝炎等，慢性感染易导致胆结石、肝纤维化，晚期可发生肝硬化，甚至原发性胆管癌和肝癌[1-3]。在全球范围内有近3 500万人感染华支睾吸虫，给人们的健康带来巨大威胁[4-5]。因此，有必要通过对华支睾吸虫基因组和功能基因组的研究，寻找合适的疫苗候选分子并深入研究其保护机制。

    硫氧还蛋白跨膜蛋白(TMX)属于硫氧还蛋白超家族的成员之一，具有还原酶的特性，且广泛分布于多细胞生物。有研究报道，TMX可阻断主要组织相容性复合体Ⅰ类重链，从而在炎症或感染等病理状态下发挥免疫保护作用[6-8]。本研究主要运用生物信息学方法对华支睾吸虫TMX(Cs TMX)基因及相应氨基酸序列的同源性、理化性质、保守结构域、信号肽、跨膜结构域、亲水性/疏水性、三级结构及活性位点进行预测分析 ......