HLA新等位基因HLA-DRB1*09:19的确认及序列分析
碱基,外显子,1资料与方法,2结果,3讨论
孙 昂,粟玉萍,代 敏,苏湘晖,胡 滨(岳阳市中心血站,湖南414000)
HLA新等位基因HLA-DRB1*09:19的确认及序列分析
孙 昂,粟玉萍,代 敏,苏湘晖,胡 滨
(岳阳市中心血站,湖南414000)
目的应用DNA测序方法确认人类白细胞抗原(HLA)-DRB1新等位基因。方法应用基因测序技术对造血干细胞捐献者进行HLA分型,发现1个与HLA-DRB1*09相关的异常等位基因,采用Sanger法对其第2外显子进行测序分析,以确认是否为新的基因序列。结果1例样本DRB1*09:XX第2外显子序列与所有已知等位基因序列均不一致,与DRB1*09:01:02高度相似,外显子2区域中的149位碱基发生了C→T碱基替代,并导致了相应氨基酸序列苏氨酸突变为甲硫氨酸。结论该等位基因为HLA-DRB1*09组中的1个新等位基因,被WHO的HLA因子命名委员会证实命名为DRB1*09:19。
HLA-DR抗原/遗传学;HLA抗原;等位基因;核酸探针;序列分析
自 1958年发现第 1个人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA),人类开始了对HLA的研究。随着分子生物学技术和测序技术的发展,对HLA的研究逐步深入[1]。中华骨髓库岳阳HLA分型实验室在对造血干细胞捐献志愿者进行HLA分型时,发现1例HLA-DRB1新等位基因,现报道如下。
1 资料与方法
1.1 标本来源 造血干细胞捐献志愿者,湖北籍,汉族,男,2013年12月在岳阳市捐献血液时同意捐献造血干细胞,2014年5月在本实验室HLA分型中因与软件数据库中所有已知HLA-DRB1位点等位基因核苷酸序列不一致而进一步确认 ......
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