肺泡灌洗液宏基因组二代测序技术在重症肺炎患者中的临床价值*
病原体,1资料与方法,2结果,3讨论
陈友莲,刘雪燕,陈怀生,洪澄英,张华东(深圳市人民医院重症医学科,广东 深圳 518020)
由细菌、真菌或病毒引起的肺部感染在世界范围内的发病率和死亡率均逐步上升,是导致总寿命下降的第三大原因[1]。因此需要进行机械通气的重症肺炎死亡率为30%~70%,病原体通常为革兰阴性菌,如不动杆菌属、铜绿假单胞菌和肺炎克雷伯菌、革兰阳性菌,如金黄色葡萄球菌和肠球菌及一些病毒等[2]。传统的病原体检测方法阳性率低且耗时,不能满足当前对快速和精准感染性疾病诊断的需求[3]。宏基因组二代测序技术(mNGS)是一种高通量测序方法,可以检测病原微生物和标记基因,例如抗生素抗性基因等,检测效率高且周转时间短,从而有可能快速、准确诊断感染性疾病病原体[4]。关于mNGS在重症肺炎患者病原学诊断中的应用报道仍然很少,特别是使用肺泡灌洗液(BALF)样本进行检测的研究。本研究对收治的58例重症肺炎患者的临床资料进行回顾性分析,以探讨肺泡灌洗液mNGS 在重症肺炎患者病原检测及指导治疗方面的临床应用价值,现将结果报道如下。
1 资料与方法
1.1一般资料 回顾性分析 2019 年 1 月至 2021 年 1 月深圳市人民医院收治的 58 例行支气管镜肺泡灌洗液mNGS检测及传统培养检测的重症肺炎患者的临床资料。重症肺炎诊断标准标准按照2007年美国感染病学会(IDSA)/美国胸科学会(ATS)制定的标准进行诊断[5]。其中男30 例,女28 例;年龄 25~78岁,平均(62.5±12.0)岁。本研究为回顾性研究,肺泡灌洗液标本采集及mNGS检测已得到患者授权家属同意,并签署知情同意书,符合医学伦理学原则,并获得深圳市人民医院医学伦理委员会批准。
1.2方法
1.2.1标本采集[6]充分做好术前准备,签署知情同意书。根据临床体征及影像学检查确定目标灌洗肺段,2%利多卡因行表面麻醉,根据镜下所见将纤维支气管镜插入至病变最为严重的肺段,分次快速注入 37 ℃ 灭菌生理盐水,每次 25~50 mL灌洗病变肺段支气管,灌洗后负压吸引回收灌洗液(一般回收率为 30%~50%),装入无菌容器中 ......
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