基于生物信息学分析胶质母细胞瘤中RUNX1基因的表达及临床意义*
差异基因,补体,调节,1材料与方法,2结果,3讨论
陈亚伦,宋 彦(南阳市第二人民医院神经内科,河南 南阳 473012)
胶质母细胞瘤(GBM)也称为多形性成胶质细胞瘤,其生长迅速、侵袭性强,是成人最常见的恶性脑肿瘤。与其他固体肿瘤不同,GBM能够广泛地侵犯周围脑组织而很少发生转移[1]。目前,GBM的标准治疗包括外科手术切除和替莫唑胺联合放射治疗。但是,经过标准治疗的肿瘤患者,病情仍然会进一步发展,导致患者的中位生存期和无疾病进展期明显缩短,分别仅为16、7个月,其5年生存率不超过9.8%[2-4]。另外,GBM发生的分子机制仍然不是很清楚。因此,深入研究GBM恶性生长与侵袭的分子机制,对于研发新的治疗方法和药物,以及改善GBM患者的生存预后具有重要意义。
本研究通过对GBM相关的三组基因芯片数据进行分析,发现了关键的促癌基因 Runt相关转录因子1(RUNX1)。RUNX1是RUNX转录因子家族的成员,主要参与细胞的增殖和分化等过程[5]。已有研究表明,RUNX1在多种人类肿瘤中异常表达,比如乳腺癌、前列腺癌和肺癌等,在肿瘤的发生、发展中起着重要作用[6-8]。但是,RUNX1在GBM中的作用仍少有报道,因此,本研究通过生物信息数据库挖掘的方法,寻找GBM的潜在预后指标或分子标志物,并初步分析了RUNX1的表达与GBM发生的关系及作用机制,以期能够为GBM的治疗提供新的理论依据。
1 材料与方法
1.1材料来源 检索GEO数据库中GBM基因芯片。通过GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)进行检索和筛选[9],得到GBM相关的基因芯片GSE50161、GSE108476和GSE15824。它们均来源于相同的平台GPL570 ([HG-U133_Plus_2] Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array) ......
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