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编号:354665
基于数据库挖掘CLEC16A基因在KIPAN中的表达及其临床意义*
http://www.100md.com 2022年10月1日 现代医药卫生 2022年第18期
通路,样本,1资料与方法,2结果,3讨论
     郭亚楠,陈佳雯,蒋奕斌,温珍珍,林泱泱,朱潘婵,钱 晶,3△

    (1.湖州师范学院医学院,浙江 湖州 313000;2.湖州学院,浙江 湖州 313000;3.浙江省媒介生物学与病原控制重点实验室,浙江 湖州313000)

    肾细胞癌(RCC)是起源于肾皮质或肾小管上皮细胞的恶性肿瘤[1],是癌症死亡的重要原因之一[2]。根据组织学类型,RCC可分为肾透明细胞癌、乳头状RCC、肾嫌色细胞癌、未分类细胞癌和Bellini集合管癌等[3]。混合性癌以存在2种及以上类型的恶性细胞和多型性细胞为主要病理特点[4],肾透明细胞癌是混合肿瘤组织学患者最常见的病理类型,其他原发性肿瘤有肾乳头状细胞癌和肾嫌色细胞癌[5]。混合性肿瘤临床较少见,混合性肾癌(KIPAN)更为罕见。由于诊断不及时,治疗延误,晚期恶性程度高,分期分级高、进展快、易转移等特点,患者预后较差[6]。肾癌具有多重耐药性[7],国内以根治性肾切除术为首选治疗方式[8]。C型凝集素域家庭16成员A(CLEC16A)是最近通过全基因组关联(GWASs)鉴定出的C型凝集素受体(CLRs)家族成员之一[9],已有多项研究证实CLEC16A与多发性硬化症、1型糖尿病等多种自身免疫性疾病有密切关系。目前,国内外关于CLEC16A的研究较少,对其在疾病中起到的确切作用机制尚不清楚[10],因此,探索发现CLEC16A在KIPAN发生、发展中的分子机制和基因调控网络,进而在分子水平上预防或阻断关键过程,以达到临床治疗、改善预后显得尤为重要。

    本研究利用多个在线数据库分析CLEC16A在KIPAN中的表达,分析CLEC16A在KIPAN中的作用及对KIPAN患者预后的影响,为进一步研究CLEC16A在KIPAN的发生、发展及预后中的意义提供一定理论依据和参考,也为进一步试验研究奠定理论基础。

    1 资料与方法

    1.1资料 从UCSC数据库(https://xenabrowser.net/)中下载经统一标准化的泛癌数据集:TCGA Pan-Cancer(PANCAN,N=10535,G=60499),从中提取ENSG00000038532(CLEC16A)基因在各个样本中的表达数据。从TCGA数据库(https://portal.gdc.cancer.gov/)下载KIPAN组织和癌旁组织CLEC16A的mRNA表达数据及KIPAN患者的临床数据。

    1.2方法

    1.2.1基因差异分析 从UCSC数据库获得样本数据,并进一步筛选来源为Solid Tissue Normal、Primary Blood Derived Cancer-Peripheral Blood、Primary Tumor的样本 ......

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