婴幼儿血管瘤异常表达基因分析*
信息学,胞外基质,分子,1资料与方法,2结果,3讨论
何丹华,陈知英,陈国菊(暨南大学附属深圳市宝安区妇幼保健院皮肤美容科,广东 深圳 518102)
婴幼儿血管瘤(IH)是婴幼儿最常见的良性肿瘤,发病率为3%~10%[1]。有研究发现,女性、高加索人、低体重早产儿、多胞胎、大龄婴儿更易患病[2]。约10%的IH患儿在1年内可自行缓解,而其余90%的IH患儿需3~10年或更长时间才能好转[3],部分患儿会留下瘢痕而影响美观[4],甚至造成永久性毁容。IH并发症包括溃疡、出血、视力障碍、气道阻塞、充血性心力衰竭等,在某些情况下IH甚至可能导致死亡[5]。如能在IH早期积极干预、促进自发消退过程、减少血管瘤对周围组织的侵袭则能改善患儿预后。因此,有必要深入探讨IH的调控过程,以更好地理解IH的发病机制,对研发相关药物具有重要意义。本研究采用生物信息学方法筛选IH的差异表达基因(DEGs)及其功能富集通路,筛选靶基因,旨在为后续研究提供新思路。
1 资料与方法
1.1研究对象 2022年2月通过公开的GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)检索与IH相关文献,获取基因表达谱数据集(GSE127487)进行分析。该基因表达谱种属为人类。样本来源于皮肤组织。芯片平台:GPL10558 Illumina HumanHT-12 V4.0 expression beadchip。选取该数据集中IH患儿18例,健康对照组研究对象5例。
1.2方法
1.2.1DEGs的识别 通过R 4.1.0的GEOquery包从GEO数据库中下载 GSE127487 ......
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