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编号:1803349
基于数据挖掘探究溪黄草药用成分及潜在抗癌的作用机制*
http://www.100md.com 2024年4月7日 现代医药卫生 2024年第6期
靶标,靶点,1资料与方法,2结果,3讨论
     李小敏,张佳涵,梁宏轩,黄镇江,张振霞,郑玉忠,陈良辉,刘亚群

    (韩山师范学院生命科学与食品工程学院,广东 潮州 521041)

    溪黄草(Herba lsodi Lophanthoidis)为唇形科植物线纹香茶菜的干燥全草。线纹香茶草2个变种:风血草(狭基香茶菜)和纤花香茶菜,同属植物溪黄草,在一些地区也作溪黄草使用[1]。溪黄草具有很高的药用价值,常被用于治疗急性黄疸型肝炎、急性胆囊炎、痢疾、肠炎、癃闭、跌打瘀痛等病症。现代药理学研究中溪黄草具有抗炎、抗肿瘤、抑菌、增强免疫力的作用,且具有较强的抗氧化能力。通过对溪黄草化学成分分析发现,溪黄草还具备预防癌症发生的作用。其中溪黄草甲素是目前发现的对人类宫颈癌Hela细胞增殖具有极其明显抑制作用的成分[2]。对溪黄草化学成分进一步研究发现,其除对人宫颈癌细胞有着明显抑制作用外,还对消化癌、膀胱癌、消化道疾病等具有明显抑制作用[3]。

    本研究利用多个大数据分析平台对溪黄草的有效成分进行筛选分析,结合相关数据库的疾病信息,得出溪黄草作用于癌症的靶点及机制,构建“药物-靶标-疾病”网络,为后续溪黄草辅助治疗癌症的作用机制提供理论参考。

    1 资料与方法

    1.1溪黄草成分的筛选 通过中国知网(http://www.cnki.net/)检索关键词“溪黄草”,并结合BATMAN-TCM数据库(http://bionet.ncpsb.org.cn/batman-tcm/)和CancerHSP数据库(https://old.tcmsp-e.com/CancerHSP.php)收集整理溪黄草化学成分,成分名称键入化源网(https://www.chemsrc.com/casindex/)查询CAS号,运用TCMSP数据库(https://old.tcmsp-e.com)以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为条件,检索活性化学成分;在PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)中检索各成分的CAS号,下载其2D 结构并保存为SDF格式。上传至SwissADME在线平台(http://www.swissadme.ch/)进行再次筛选,设定条件:胃肠道吸收为“high”,5种DL(lipinski、ghose、veber、egan、muegg)预测结果有2个及以上为“yes”,生物利用度预测值≥0.50。

    1.2有效成分作用靶点的收集与整理 采用SwissTargetPrediction在线平台(http://www.swisstargetprediction.ch/),限定物种为“homo sapiens”,进行靶点预测 ......

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