王 洋,牛五层,张晓煜,张 丽△

    (1.国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院深圳医院检验科,广东 深圳 518116;2.邯郸市第一医院核医学科,河北 邯郸 056000)

    肺部感染是临床常见的呼吸道疾病,发病率高,是导致生命死亡的主要原因之一[1]。尤其在老年人和免疫功能低下的个体中,准确、快速地诊断感染的原因是实现肺部感染治疗和改善预后的关键。传统的培养方法耗时长,阳性检出率低,不能完全满足临床需求[2]。其他的检测方法,如聚合酶链反应(PCR)和免疫学等技术,只能识别特定的病原体。此外,多种病原体的感染和多重耐药菌的出现使病原体的鉴定更加困难。宏基因组二代测序(mNGS)是一种新兴的病原体检测方法,可以对目前已知的所有病原体的总DNA或RNA含量进行无偏倚、详细地检测[3],尤其在用于检测复杂、罕见、非典型的感染性疾病时,显示出比传统方法更好的诊断性能[4]。近年来,mNGS应用于诊断肺部感染的研究逐渐增多,但其诊断性能尚未达成共识。本研究采用meta分析方法,合并目前经公开发表的相关研究结果,评估mNGS在肺部感染中的应用价值及准确性。

    1 资料与方法

    1.1文献检索策略 计算机检索 PubMed、Embase、the Cochrane Library、中国知网、万方、维普等数据库,检索时限均为建库至2022年5月30日,语种为英文或中文。选取国内外发表的通过mNGS技术应用于肺部感染诊断的文献,并对纳入文献的参考文献进行扩大检索。英文检索词为“metagenomic next-generation sequencing”“mNGS”“next-generation sequencing”“pneumonia”“lung infection”等,中文检索词为“宏基因组二代测序”“二代测序”“肺部感染”“肺炎”等。

    1.2纳入与排除标准 纳入标准:(1)采用 mNGS 技术应用于肺部感染诊断的研究,能从文中获取诊断实验的四格表数据,包括真阳性值(TP)、假阳性值(FP)、假阴性值(FN)、真阴性值(TN) ......