黄 茜,陈颖志,甘梵飞,陶爱恩

    (丽江文化旅游学院医学院,云南 丽江 674100)

    木香收载于《中国药典》,为菊科草本植物木香Aucklandia lappa Decne.的干燥根。大量研究表明,木香中含有270余种成分,其中包括具有调节胃肠功能、抗肿瘤、抗菌和抗炎作用的挥发油、萜类、糖苷、氨基酸及胆胺类等物质[1-4]。近年来,随着对木香化学成分、药理活性及临床应用等方面的深入研究,学者们发现木香在抗炎、抗癌、抗溃疡、抗病原微生物及其他多个领域表现出显著的药理活性[5]。药理学研究发现,木香中的活性成分对多种癌细胞具有毁灭作用,但是关于木香在胃癌中的作用研究较少见。本研究借助网络药理学和分子对接技术,通过药物-疾病-作用靶点等多途径调节的理念阐述药物治疗疾病的作用机制,进一步为阐述木香治疗胃癌提供理论依据。

    1 资料与方法

    1.1一般资料 利用中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP),对木香的活性成分进行查询,并查阅相关文献。在此基础上,筛选并预测木香关键活性成分和核心靶点。

    1.2方法

    1.2.1筛选木香成分靶点 使用TCMSP(https://tcmsp-e.com/)检索木香活性成分,筛选活性成分的选择条件为口服生物利用度(OB)大于或等于30%,类药性(DL)大于或等于0.18。通过对整理得到的靶点进行Uniprot(https://www.uniprot.org/)数据校准,以获得标准化的基因名。同时,为了确保所有蛋白名称都符合规范,限定输入蛋白名称所属物种为“Homo sapiens”。

    1.2.2胃癌疾病靶点筛选 在GeneCards和DisGeNET数据库中分别使用关键词“gastric cancer”进行搜索,获取相关疾病的靶点。将这些靶点整合并去除重复值,得到最终的疾病靶点集合。将获得的药物靶点与疾病靶点进行相互映射,并利用Venn图确定靶点之间的共同基因。最后,借助Cytoscape3.8.2软件构建一个包含“药物-疾病-作用靶点”网络。

    1.2.3木香与胃癌靶点蛋白质相互作用(PPI)网络构建 为了进一步研究木香在治疗胃癌时蛋白质之间的相互作用,将药物-交集基因上传至相互作用数据库String(https://string-db.org/),进行PPI网络构建。选择“Homo sapiens”物种,默认参数,将最终结果保存为TSV格式,导入Cytoscape3.8.2软件中进行网络分析(Cytoscape→Tools→Network analyzer→Network analysis→Analyze network),并保存网络分析结果 ......