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编号:765662
基于纯培养方法和PacBio三代测序技术研究蒙古国传统酸马奶中乳酸菌多样性
http://www.100md.com 2019年5月18日 中国食品学报 2019年第4期
球菌,菌种,1材料与方法,2试验方法,2结果与分析,1酸马奶中乳酸菌的纯培养法分离鉴定,2酸马奶中乳酸菌宏基因组学多样性分析,3讨论和结论
     刘文俊 多拉娜 刘亚华 任冬艳 张和平 孟和毕力格

    (内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室 农业农村部奶制品加工重点实验室内蒙古自治区乳品生物技术与工程重点实验室 呼和浩特010018)

    酸马奶是以新鲜马奶为原料,经乳酸菌和酵母菌等微生物共同自然发酵形成的酸性、 低酒精含量的乳饮料[1]。酸马奶中含有丰富的蛋白质、脂肪、糖类、维生素、氨基酸等营养成分。有研究表明:在所有可食用畜乳中,马乳的组成最接近人乳[2]。除营养丰富外,酸马奶还具有驱病保健的功效,蒙医学的相关研究表明酸马奶具有降血压,降血脂,防止肺结核,治疗便秘、黄褐斑等疗效[2-4]。目前在蒙古国和内蒙古等地区均设立了“酸马奶疗养中心”,利用酸马奶治疗心血管系统病、消化系统病、 神经系统疾病和结核等慢性消耗性疾病均有一定疗效[5]。酸马奶中的乳酸菌赋予酸马奶独特风味特征,同时其代谢产物与酸马奶的医疗作用密不可分。全面深入了解传统酸马奶中的细菌多样性和菌群组成,分离筛选具有优良特性的乳酸菌菌株,对酸马奶品质改良,工业化应用以及益生菌的开发利用具有重要意义。

    传统的纯培养方法是常用来研究生态环境中的微生物组成的经典方法,其培养条件具有局限性,有研究表明自然界中只有不到1%的微生物可以培养[6],这表明纯培养方法不能完全揭示样品中的微生物组成。宏基因组测序技术的出现为准确、全面地了解菌相复杂的环境样品中微生物群落结构提供了有效手段。以PacBio SMRT 为代表的三代测序技术具有长读长,高通量的优点,通过其特有的CCS 测序模式,将同一条序列多次重复测序后的结果相互校正,可以获得测序质量非常高的一致性序列。借助该技术研究人员可以在“种”水平对样品中的微生物进行分析[7]。

    本研究以采集自蒙古国的12 份酸马奶为对象,通过纯培养方法分离样品中的乳酸菌,并应用16S rRNA 测序技术对其进行鉴定。同时采用PacBio SMRT 测序技术分析样品中的乳酸菌多样性,以期为传统酸马奶的品质改良和工业化生产提供理论依据,为具有良好益生特性的乳酸菌的筛选和研究奠定基础。

    1 材料与方法

    1.1 材料

    1.1.1 样品来源 本研究用的12 份传统酸马奶样品采自蒙古国的7 个省区,具体采样信息见表1。

    表1 蒙古国传统酸马奶样品的采集信息表Table1 Information of traditional koumiss samples in Mongolia ......

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