Capture-SELEX技术筛选β-苯乙胺核酸适配体
磁珠,文库,亲和力,1材料与方法,1材料与试剂,2仪器与设备,3方法,2结果与分析,1ssDNA文库的固定,2溶解曲线监测适配体筛选的富集,3β-苯乙胺适配体序列分析,4亲和力和特异性试验,3结论
糜唯钰,段 诺,吴世嘉,姬 华,王周平(石河子大学食品学院 新疆石河子832003)
β-苯乙胺是一种重要的芳香族生物胺,作为中枢神经系统中神经递质的调节剂,存在于哺乳动物组织中,高浓度的β-苯乙胺会导致β-内啡肽释放,诱导产生去甲肾上腺素,从而引发高血压和偏头痛等症状[1]。在奶酪、巧克力和腌制肉等食品中都存在β-苯乙胺。其潜在的毒性和作为食品质量标记的可能性,有必要对食品中的β-苯乙胺进行检测。对β-苯乙胺检测技术的研究在国内外已经开展多年,目前已建立多种检测方法,其中最主要的是基于分离技术的仪器分析法,例如高效液相色谱(HPLC)[2-5],气相色谱(GC)[6-9]和毛细管电泳(CE)[10-12]等。这些方法可对β-苯乙胺进行精确的定量分析,然而也受到一些因素的限制,如仪器价格昂贵,检测耗时较长以及需要专门技术人员操作等。
核酸适配体(Aptamer)是通过指数富集的配基系统进化技术(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX),筛选获得的一种单链寡核苷酸(ssDNA 或RNA),可折叠形成三级结构,该结构可特异性识别并结合靶标。核酸适配体不仅具有与抗体相似的亲和力和特异性,而且还具有其它优点,例如更短的合成时间,更低的制造成本,更少的批次间差异性,更高的可修饰性,更好的热稳定性以及更广泛的目标种类[13-15]。基于此,核酸适配体被广泛用于临床诊断和治疗剂[16-18],食品安全检测[19-21]和环境监测[22-24]等众多领域。
小分子靶标适配体的筛选大都采用在固相材料表面固定靶标分子的SELEX 技术,该技术存在固定操作复杂,固相材料的空间位阻和靶标分子构象可能改变等缺点。基于固定ssDNA 文库的捕获SELEX(Capture-SELEX)无需固定靶标分子,避免了上述问题,更适用于可溶性小分子靶标核酸适配体的筛选[25-27]。Capture-SELEX 技术通过特别设计的一段生物素化的反义寡核苷酸链,与核酸适配体筛选文库固定区域的一端互补结合,从而将ssDNA 文库固定在抗生物素蛋白包被的磁珠表面。筛选过程中,能够与靶标形成复合物的适配体从磁珠表面解离,通过收集上清,PCR 扩增,制备单链等步骤[28-30],获得下一轮筛选的次级文库。经多轮筛选,就可获得对靶标具有高亲和力和特异性的适配体。
迄今为止,特异性结合β-苯乙胺的ssDNA 适配体尚无报道。本研究通过Capture-SELEX 技术筛选对β-苯乙胺具有高亲和力和特异性的ssDNA 适配体 ......
您现在查看是摘要页,全文长 12457 字符。