基于TaqMan探针荧光PCR检测致泻性大肠埃希氏菌
引物,1材料与方法,1试验菌株,2主要仪器和试剂,3方法,2结果与分析,1荧光PCR扩增体系评价,2多重实时荧光PCR特异性试验结果,3模拟样品检测结果,3讨论
袁慕云,许龙岩*,柯碧霞,陈 瑶(1 广州海关技术中心 广州510623 2 广东省疾病预防控制中心 广州510440 3 南方医科大学 广州510515)
致泻大肠埃希氏菌(diarrheagenic Escherichia coli,DEC),可通过污染食物引起人类发病,主要包括肠道致病性大肠埃希氏菌(enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)、产肠毒素大肠埃希氏菌(enterotoxigenic Escherichia coli,ETEC)、产志贺毒素大肠埃希氏菌 (Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC)、肠道侵袭性大肠埃希氏菌(enteroinvasive Escherichia coli,EIEC)、肠道集聚性大肠埃希氏菌 (enteroaggregative Escherichia coli,EAEC)[1-4]。随着对DEC 致病机制认识的深入和分子生物学技术的发展,采用普通PCR 或荧光PCR 方法检测DEC 越来越受到认可并广泛应用,而普通PCR 方法产物需要通过电泳进行观察,操作繁琐,而且部分目的片段大小差异在20 bp 左右,用琼脂糖电泳难以区分[5-9]。朱林英等[10]根据DEC 的8 种毒力基因设计引物,检测1 658 份粪便样品。陈爱萍等[11]根据DEC 部分基因用荧光PCR 检测DEC。胡安妥等[12]根据11 种毒力基因建立两组多重荧光PCR 扩增体系检测DEC,然而,不能区分扩增的志贺毒素基因是Stx1 和Stx2 中的哪一种,而且均未系统分析扩增体系的扩增效率、线性相关系数R2等荧光PCR 关键参数。本研究根据bfpB(bundle-forming pilus B,束状菌毛B基因)、eaeA (gene encoding intimin for Escherichia coli attaching and effacing,紧密素基因)、LT(heat-labile enterotoxin,热不稳定性肠毒素基因)、ST(heat-stable enterotoxin,热稳定性肠毒素基因)、Stx1(Shiga toxin one,志贺毒素Ⅰ基因)、Stx2(Shiga toxin two,志贺毒素Ⅱ基因)、ipaH(invasive plasmid antigen H-gene,侵袭性质粒抗原H 基因)和aggR(aggregative adhesive fimbriae regulator 集聚黏附菌毛调节基因)设计引物和探针 ......
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