分子对接技术筛选鲈鱼肌球蛋白中黄嘌呤氧化酶抑制肽
残基,1材料与方法,1材料与试剂,2仪器与设备,3试验方法,2结果与分析,1鲈鱼肌球蛋白虚拟酶解结果,2多肽与黄嘌呤氧化酶的分子对接结果,3结论
赵贵琴,李婷婷,宋敏杰,孙 宏,励建荣*,谢 晶,邓尚贵痛风作为一种常见的慢性病,其发病人数呈逐年上升趋势。目前对于痛风的治疗方法主要有抑制尿酸生成和促进尿酸排泄两种,其中抑制尿酸生成的药的效果远高于促进尿酸排泄的药[1]。常用的抑制尿酸生成的药,例如别嘌呤醇、非布司他这类化学药物对肾脏有较大的副作用,不宜长期使用[2]。开发生物活性成分作为黄嘌呤氧化酶抑制剂成为近年的研究热点。例如:Li 等[2]从脱酚核桃水解产物、大豆水解产物和鲣鱼水解产物中提取出黄嘌呤氧化酶抑制肽;姚兰等[3]从大叶冬青中分离出了抑制黄嘌呤氧化酶的有效成分;Shi 等[4]从尖蕾狗牙花中分离出的生物碱成分也能较好地抑制黄嘌呤氧化酶。此外,高良姜[5]、鼠曲草[6]、芦荟[6]、槲皮素[7]等植物源性前体物质中都分离出可有效抑制黄嘌呤氧化酶作用的物质。
嘌呤类物质是引起痛风的前体物质,且黄嘌呤氧化酶(Xanthine oxidase,XOD)是人体尿酸代谢中的最后一个酶,该酶在治疗高尿酸血症及通风方面受到广泛关注。有研究指出可以通过抑制黄嘌呤氧化酶的活性来减少尿酸的生成[8]。目前已报道许多植物源的黄嘌呤氧化酶抑制剂,如绿原酸[9]、黄酮类物质[10]、白皮杉醇[11]、白藜芦醇[11]、异丹叶大黄素[11]等,而动物源性的黄嘌呤氧化酶抑制剂鲜有报道。本文选取鲈鱼体内的一种肌球蛋白作为研究对象。
传统的蛋白质纯化方法根据蛋白质的溶解度、分子大小、带电性质和配体特异性的分离方法分为四类[12]。其中根据溶解度的大小纯化蛋白可以用盐析、等电点沉淀和低温有机溶剂沉淀法;根据蛋白质分子大小可以用透析、超滤和凝胶过滤法;根据带电性质可用电泳法和离子交换层析法;根据配体特异性分离可以用亲和色谱法[13-16]。传统的蛋白纯化方法具有过程繁琐、历时长,且得到的产物纯度低、产量小等缺点。分子对接技术可以缩短蛋白纯化过程所需时间,并可很好地筛选出所需的多肽,对多肽进行生物活性预测及试验验证,得出效果良好的多肽。吕靖[17]通过分子对接技术筛选到可以抑制脲酶活性的抑制剂,尿素的快速水解会引起氨的非生产性挥发,造成局部环境pH值的升高,给环境和人体带来负面影响,通过筛选脲酶抑制剂以缓解对环境和人体造成的危害。樊玥[18]利用分子对接技术将三肽与黄嘌呤氧化酶对接,筛选出其中具有较强ACE 抑制效果的三肽。Palakurti 等[19]利用虚拟筛选、3D 建模筛选出β-分泌酶抑制剂,这类酶抑制剂可以有效缓解阿尔兹海默症。Wu 等[20]利用分子对接技术成功地从甜高粱籽粒酶解产物中筛选出血管紧张素转换酶抑制肽 ......
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