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编号:39206
基于宏基因组分析酸马奶的微生物多样性及功能基因
http://www.100md.com 2022年3月4日 2022年第2期
脱氢酶,风味,氨基酸,1材料与方法,1试验材料,2试剂与仪器,3试验方法,2结果与分析,1酸马奶微生物多样性分析,2常用数据库注释分析,3蛋白质水解系统基因分析,4氨基酸风味形成途径,3结论
     夏亚男, 刘 皓, 双 全

    (内蒙古农业大学食品科学与工程学院 呼和浩特010000)

    传统酸马奶(Koumiss)制作和食用历史悠久,是最受中亚和东欧地区人们喜爱的传统发酵乳饮料,它不仅营养丰富,而且对某些疾病有治疗效果[1-2]。在我国,酸马奶是一种具有民族特色的发酵乳饮料, 我国内蒙古和新疆地区人民对其十分偏爱。新鲜的马奶在乳酸菌、酵母菌和其它微生物的共同作用下,经特定温度和时间发酵形成酸马奶。酸马奶具有良好的、 特殊的风味口感和一定的医疗保健作用,如有助于人体消化吸收、预防各种肠胃道疾病,还可以降低血脂和胆固醇[3-4]。

    酸马奶独特风味及功能特性的形成与其复杂的微生物群落密切相关。 微生物将鲜马奶中的各类营养物质(碳水化合物、蛋白质、脂肪酸等)不断分解、代谢,生成相应的风味物质以及具有特定功能的生物活性成分。 近年来,采用16s rRNA 技术[5-6]检测酸马奶的微生物多样性时发现传统方法发酵得到的酸马奶中, 乳酸菌和酵母菌占菌群的绝大部分,不同微生物之间存在相互作用,其微生物菌群体系与开菲尔非常相似[7-8]。采用16s rRNA技术检测酸马奶的微生物多样性只能确定到属水平,无法精确到种水平,对功能基因的挖掘存在一定的局限性。

    宏基因组学(Metagenonics)是基于提取特定环境中全部微生物的DNA, 构建宏基因组文库,来探索微生物群落功能, 挖掘功能基因的一门技术[5-8]。传统宏基因组学研究技术包括芯片、克隆测序、变性梯度凝胶电泳等,这些技术已在许多领域取得重大突破, 例如在土壤和海洋等环境样品的研究中[9-11]。 Li 等[12]通过宏基因组学技术研究3 种牛乳(新鲜牛乳、含抗生素的牛乳以及经巴氏杀菌且含有抗生素的牛乳) 对牛犊瘤胃中微生物的影响,结果表明,饮用含有抗生素的牛乳影响瘤胃中微生物群落结构及丰度, 同时与细胞周期相关的酶的数量也发生变化。 通过对功能基因及关键酶的挖掘,揭示牛乳中抗生素残留的安全问题。

    目前,已有对酸马奶微生物多样性的研究,然而,微生物在种水平上尚不明确,功能基因也几乎处于空白阶段,需要开展深入研究。本试验利用宏基因组学和生物信息学分析手段, 在分类学地位“种”水平上对酸马奶中核心微生物类群进行甄别,分析酸马奶的微生物多样性,并挖掘群体微生物中的功能基因, 以期为我国酸马奶产业的发展及乳酸菌资源开发提供理论依据。

    1 材料与方法

    1.1 试验材料

    酸马奶于2019年6月采自于内蒙古自治区锡林郭勒盟阿巴嘎旗 ......

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