基于Illumina 高通量测序分析相温贮藏对黄花菜表面微生物的影响
群落,真菌,1材料与方法,1试验材料,2试验方法,3数据处理,2结果分析,1不同处理黄花菜感官图片和褐变率分析,2物种注释,3基于OTU的花瓣图分析,4属水平注释概况,5样本复杂度分析,6多
张 鹏,刘英杰,贾晓昱,薛友林,李江阔*(1 天津市农业科学院农产品保鲜与加工技术研究所 天津 300384 2 国家农产品保鲜工程技术研究中心(天津)农业农村部农产品贮藏保鲜重点实验室 天津市农产品采后生理与贮藏保鲜重点实验室 天津 300384 3 辽宁大学轻型产业学院 沈阳 110036)
黄花菜(Hemerocallis citrina Baroni)又称金针菜、柠檬萱草,是我国特有的药食同源珍有蔬菜[1]。截至2020 年底,我国黄花菜种植面积占全球总面积约98%,是山西大同、甘肃庆阳、宁夏吴忠、陕西大荔等地区重要种植经济作物[2]。黄花菜味质鲜美,肉质厚,口感佳,营养丰富,其所含的碳水化合物、蛋白质、脂肪分别占到60%,15%,2%[3]。现代药理研究表明,黄花菜的次级代谢产物如多酚和黄酮具有抗抑郁、抗癌、抗菌、抗炎、抗氧化和保肝功效[4]。它既是佐餐佳品又是药用保健食品,深受人们的喜爱。尤其是种植地当地的消费者,喜欢吃新鲜的黄花菜,然而黄花菜不耐储,保鲜期极短,久贮后表面会生绒毛,产生腐烂,在运输和贮藏中易霉变[5]。霉变会对黄花菜的产量和商业价值产生影响,同时霉菌会产生毒素,危害人体健康。弄清贮藏期间黄花菜表面的主要微生物,寻找相关抑制方法,对黄花菜产业的发展十分重要。
高通量技术作为一种非培养技术,在食品微生物学领域应用的越来越多[6]。它可以检测食品微生物的群落结构,具有测序通量高、结果精准等优点[7],在基因组测序、功能基因组学、表观基因组学等方面广泛应用[8-10]。目前,基于16S/18S/ITS 的二代高通量测序技术已较为普遍地应用于果蔬微生物菌群的多样性研究。Zhang 等[11]采集14 个地区的28 个核桃样品,对细菌16S rRNA 的V4 区进行高通量测序分析,研究细菌在核桃壳表面的分布,得到蓝藻门是核桃壳表面主要致病菌。李婕等[12]分别运用16S rRNA 高通量测序技术和平板分离培养法探究双孢蘑菇在贮藏温度4 ℃的环境下,菇体表面细菌的种群结构及其变化情况,结果显示,随贮藏时间延长,菇体表面细菌菌群丰度逐渐增加,其中,主要致腐菌为假单胞菌(Pseudomonas spp)。然而,目前基于高通量技术对黄花菜表面微生物的研究较少,对引起黄花菜霉变的主要菌群尚不清楚。
本试验以微环境气调箱为载体,将采收的黄花菜分组放入冰箱(4 ℃±1 ℃)、冷库(0 ℃±0.5 ℃)及相温环境(-0.5 ℃±0.1 ℃)中。在进行品质检测的基础上,通过对其表面真菌、细菌的宏基因组检测,确定主要微生物种群 ......
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