基于生物信息学和网络药理学探究左金丸治疗幽门螺杆菌相关性溃疡的分子机制
吴茱萸,黄连,1材料与方法,1左金丸活性成分收集,2活性成分靶点预测,3Hp相关性PU基因表达谱芯片数据获取,4Hp相关性PU与正常胃组织差异表达microRNA筛选,5Hp相关性PU胃黏
吴嫚婷 吴 佳 仇婧玥 龙 荣 宋厚盼(1.湖南中医药大学中医学院,湖南 长沙,410208;2.湖南中医药大学医学院,湖南 长沙,410208;3.湖南中医药大学中医诊断学湖南省重点实验室,湖南 长沙,410208)
消化性溃疡(PU)是一种以胃、十二指肠黏膜形成慢性溃疡为特征的上消化道疾病,主要病理改变为黏膜的局限性组织缺损、炎症与坏死性病变,深达黏膜肌层。PU 发生机制主要与胃酸、胃蛋白酶的自身消化有关[1]。临床上患者常以周期性上腹痛、反酸、嗳气为主要表现,易反复发作,很难治愈。现代医学认为PU 的发生与许多因素有关,最常见的有幽门螺杆菌(Hp)感染、药物滥用、情绪不良、精神紧张、饮食无规律、吸烟饮酒[2]。本病多发于20~50 岁的成年人,男性居多。随着社会经济发展,人们饮食结构与生活习惯发生改变,消化性溃疡发生率逐年增加[3]。目前临床上对该疾病的治疗主要从抑制胃酸分泌、根除Hp、保护胃黏膜等几个方面下手,常规采用三联疗法或四联疗法[4]。
Hp 相关性PU 中医病名为“胃痛”“嘈杂”“胃疡”。中医药治疗PU 有良好的疗效,除了能改善症状,不良反应和耐药现象也比较少,复发率低。左金丸由元代医家朱震亨所创,主要用于治疗肝郁化火横犯胃气导致的胁痛、呕吐、吞酸等,由黄连和吴茱萸两味药物组成。现代药理学研究表明,左金丸具有抗炎镇痛、抗菌、抑制胃酸和胃泌素分泌、胃蛋白酶活性等功效,是治疗Hp 相关性PU、Hp 相关性胃炎等疾病的常用方[5]。
网络药理学运用网络方法研究药物与疾病和靶点之间“多成分、多靶点、多途径”的协同作用关系。其整体性、系统性和注重药物间相互作用的特点与中医药学整体观思想相吻合,从系统层面揭示中药对机体调控网络作用[6]。本研究旨在运用网络药理学和生物信息学方法筛选左金丸治疗Hp相关性PU 涉及的分子机制。
1 材料与方法
1.1 左金丸活性成分收集
登录TCMSP 数据库(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php),点击Herb name,依次输入“吴茱萸”和“黄连”,分别检索两味药物的成分信息和相关靶点,在成分信息中筛选出口服生物利用度 (OB)≥30%和药物相似性(DL)≥0.18 的活性成分,保存吴茱萸和黄连的活性成分及其相关参数。
1.2 活性成分靶点预测
Swiss Target Prediction(http://www.swisstargetprediction.ch)可根据配体的2D、3D 结构精确预测生物活性分子靶点 ......
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