中医学理论中，有选择地運用数的观念，如 《黄帝内经》云：“夫四时阴阳者，万物之根本也 …… 故阴阳四时者，万物之终始也，死生之本也。逆之则灾害生，从之则苛疾不起，是谓得道。”“夫五运阴阳者，天地之道也。万物之纲纪，变化之父母，生杀之本始，神明之府也，可不通乎 ”(《素问·天元纪大论》)。

    “天之道也，此因天之序，盛衰之时也 ”(《素问·六微旨大论》)。这里的“四时阴阳 ”“五运阴阳 ”“因天之序，盛衰之时”皆是“数 ”。不仅如此，事实上 《黄帝内经》处处体现了“数”思维，如认为“因时之序”才能“生气通天 ”(《素问·生气通天论》)，认为“四气调神”是养生之要务 (《素问·四气调神大论》)。对于脏腑，《黄帝内经》强调“脏气法时”之论 (《素问·脏气法时论》); 对于发病，《黄帝内经》有“反此三时，形乃困薄”之说 (《素问·生气通天论》); 对于治法，《黄帝内经》要求“合人形以法四时五行而治 ”(《素问·脏气法时论》); 又如 《灵枢·九针论》：“夫圣人之起天地之数也，一而九之，故以立九野，九而九之，九九八十一，以起黄钟数焉，以针应数也。”《灵枢·九针十二原》曰：“始于一，终于九 ”。

    在中医的其他经典中，也有类似的论述。如 《伤寒论》中的三阳三阴，即“六经”的时序、传变及辨证施治等都与“数”不可分割;《金匮要略》总论 ......