脓毒症大鼠脾组织基因表达变化(2)
1.2 脾组织标本的采集于术后24 h在氯胺酮腹腔麻醉下迅速剖腹、取脾,立即置入液氮中,-70 ℃保存。
1.3 基因芯片杂交及检测
基因芯片杂交和检测的方法参照文献[3-4]。
1.4 差异表达基因的比较
观察脓毒症组与对照组基因表达差异。
1.5 RT-PCR验证
根据差异表达基因,随机选取Procr、Cxcr4两个基因作RT-PCR来验证数据的可靠性。
1.5.1 引物设计 利用 primer premier 3 v 0.4.0 引物设计软件设计Procr和Cxcr4的引物。并且通过NCBI中Blast功能,初步检测引物的特异性。引物由上海博星基因芯片有限责任公司合成。Cxcr4上游引物:5’CCTTATCCTGGCTTTCTTTGC 3’,Cxcr4下游引物:5’ CTCCGT GATGGAGATCCACTT 3’;Procr上游引物:5’ GAAAGGGCTGGACTGGTGG 3’,Procr下游引物:5’ CATTCTTCGTAGGCAGATGCTG 3’。
1.5.2 操作过程 把提取的总RNA逆转录成cDNA,稀释5倍, 使其质量浓度为50 ng/μl。于384孔反应板中加入如下试剂(反应体系为10 μl):Mix(2×):5 μl,Amplification primer 1 (2 μmol/L):1 μl ......
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