艾伦娜,刘昱圻,陈韵岱

    (中国人民解放军总医院: 1第一医学中心心血管内科, 2研究生院, 北京 100853;3中国人民总医院第六医学中心心血管病医学部, 北京 100142)

    冠心病是世界范围内最常见的心血管疾病[1],其中急性心肌梗死是导致死亡的主要原因之一[2]。基因调控对冠心病的发生和发展具有重要作用[3],在不同种族、性别患者中均具有一定影响[4,5]。最近,涉及数十万人的全基因组关联研究发现了许多新的冠心病相关基因位点,如影响血脂代谢和血压等的相关基因。目前,面临的主要挑战之一是进一步探索这些基因中的致病基因,并了解其导致冠心病[6]的可能的分子机制。因此,寻找潜在的分子标志物为冠心病的早期诊断和临床治疗提供了可能。微阵列分析,别名基因表达谱,被发现对揭示分子机制和预测疾病预后有关键影响[7]。大多数微阵列数据存储在公共数据库中,如基因表达(gene expression omnibus, GEO)数据库和Oncomine数据库,其中GEO数据库是由美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBD)于2000年创建并维护至今的高通量基因表达数据库,包括了多种疾病相关的高通量基因表达数据。近年来,随着高通量测序和表达谱芯片手段不断发展进步,产生了海量的测序数据,生物信息学作为一门新的学科领域也由此得到了快速发展。通过生物信息学手段,可以从基因层面分析生物学功能,从而进一步了解基因表达的调控机制,根据生物分子在基因调控中的作用,进而发现人类疾病潜在的诊断及药物的分子靶点或疾病相关分子机制,心血管领域也已有相关研究。Chen等[8]通过生物信息分析来自微阵列的基因表达谱数据,确定了单核细胞相关的3个关键基因(CUX1、CTSD和ADD3)作为早期识别急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)患者发生心力衰竭风险的潜在生物标志物;Zhu等[9]在GEO数据库中获得6个数据集,并通过生物信息手段对它们进行了识别免疫相关基因的分析及诊断模型的构建,最后发现AMI组C-C趋化因子受体(C-C chemokine receptor, CCR)、巨噬细胞、中性粒细胞、Treg细胞的比例明显高于正常组,免疫相关基因和免疫细胞与AMI密切相关,除此外仍有大量与AMI相关的生物信息学数据有待探索 ......