1941年8月5日上午，日寇7架飞机轰炸西农，投弹20余枚，炸毁教学大楼东北角之图书馆，训育员王文璜、学生宋肃孟、高职投考生张杰仁被炸死。同年11月30日，日寇5架飞机两次轰炸西农，投弹30余枚，1名校警受重伤，炸毁校礼堂并毁损仪器。

    1942年2月10日，日寇4次轰炸西农，炸死学生、家属各1人。以后多次轰炸，死难师生及家属5人，重伤3人，毁校舍房屋500余间，教学设施、农场研究试验材料、物资损失巨大。昔日召开“武功军事会议”的旧址—农专奠基大楼被多次轰炸，弹痕累累，至今清晰可见。

    杨陵上代村村民康博回忆日寇飞机轰炸西农的情景时说：“天上飞机黑压压一大片，群众好奇地从家中跑出来，转眼间西北方向咚咚的爆炸声把群众吓懵了，男女老少惘然若失地跑來跑去，不知躲在何处，有的钻到猪窝里，有的钻到地道里，有的钻到城墙的夹缝里……后日寇飞机多次来轰炸，群众惶恐不可终日。”

    西农离休老干部董振民记得：“日寇飞机轰炸损失最大的有两次。第一次是夏季上午，日寇飞机12架一排，共两排在西农上空盘旋后扔下许多炸弹，主要扔到东墙外的张家岗村、西墙外的马路上和坟地里。警报拉响后，西农男女学生各一名不去防空隐蔽，反而跑到三号楼平台上看飞机，遭到敌机扫射，其中一人当场死亡。还有一次是冬季，下午四时左右，我在北杨村的半坡上看见一架敌机机翼下带着两颗炸弹 ......