新疆，以天山为界，历史上北疆以游牧为主，而南疆则以农耕为主。新疆之南疆(天山南路)，史称回部，即《汉书》所谓“城郭三十六国”，在唐以前盛行佛教，而伊斯兰教的传播，萌芽于隋唐，大盛于元之后。不过，自元代以来，新疆的统治者是北疆的厄鲁特蒙古，而信仰伊斯兰教、农耕的南疆回部，则长期被信仰佛教、游牧的北疆准噶尔部所统治。

    因此，康熙平定噶尔丹，特别是乾隆平定阿穆尔撒纳，这对于南疆的回部来说，等于替他们打倒了长期的压迫者和统治者，这对南疆回部来说是一次大解放。自此之后，长期以来天山南北之间存在的宗教对立、民族对立，一举得到扫除，天山南北，佛教与伊斯兰教，走向了平等，而这是新疆从此走向“安定团结”的主要原因。

    清道光六年夏六月，南疆再次发生张格尔叛乱，而对于南疆重新陷入动乱的原因，魏源认为 ......