基于网络药理学研究黄连治疗心房颤动的活性成分及作用机制
小檗,靶点,1方法,2结果,3讨论
蔡 芸,信琪琪,高 群,贾文浩,靳嘉麟,董 菲,丛伟红,林 谦心房颤动(atrial fibrillation,AF)是临床最常见的心律失常之一[1],其患病率和发病率都在持续升高,严重影响病人的生存质量。心房基质重构和电重构是心房颤动发生和维持的关键病理机制[2]。心房颤动属中医“心悸”范畴,痰热扰心证已成为心房颤动病人的常见证候之一[3]。黄连源于《神农本草经》,其味苦,性寒,具有清热燥湿、泻火解毒的功效[4],针对心房颤动痰热扰心的病机,现代医家多加用黄连以发挥清心降火功效,往往可以取得较好的效果,但其作用机制尚不明确。
网络药理学是基于系统生物学的理论,运用专业网络分析软件,通过构建“药物-靶点-疾病”的网络,分析其协同关系的新学科。其强调中药对疾病的多成分、多靶点、多途径调节作用,从网络层面阐释中药治疗疾病的作用机制[5],目前已广泛应用到新药开发、多靶点治疗药物等方面[6]。中药多具有多成分、多靶点、多通路的特征,因此本研究拟通过网络药理学的方法,分析、预测黄连治疗心房颤动的药效基础、作用靶点,为从分子水平、细胞水平和基因水平阐明黄连的作用机制提供参考依据。
1 方 法
1.1 黄连成分潜在靶点网络构建 从TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Data-base and Analysis Platform)数据库中检索黄连所有成分及靶点,通过口服生物利用度(OB)、药物相似性(DL)进行活性成分筛选,阈值设定为OB>30%、DL>0.18,Uniprot数据库进行蛋白基因名的转换,再通过Cytoscape3.2.1软件对成分、潜在靶点进行可视化网络构建,利用Bisogenet插件构建成分靶点蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interactions,PPI)网络。
1.2 心房颤动疾病靶点网络构建 以“atrial fibrillation”为关键词分别检索TTD、DrugBank、美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库,获得疾病靶点,通过NCBI数据库进行蛋白基因名的转换,再通过Cytoscape3.2.1软件进行疾病靶点可视化构建,利用Bisogenet插件构建疾病靶点PPI网络。
1.3 药物活性成分-疾病靶点核心网络构建 通过Cytoscape3.2.1软件的Merge功能,将以上构建得到的“成分靶点PPI网络”与“疾病靶点PPI网络”进行Merge分析,得到药物-疾病共同相关的靶点 ......
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