盛 松，黄 烨，杨志旭，李 婧，徐凤芹

    丹参酮ⅡA(Tanshinone ⅡA，TanⅡA)是从唇形科中药丹参及其同科属植物的根分离提取得到的活性单体成分，为二萜醌类化合物。经体外实验证实TanⅡA主要具有抗血小板聚集、抑制血栓形成、降低血液黏度、扩张冠状动脉、改善心肌供血、减小心肌梗死面积等药理作用，可以治疗动脉粥样硬化、急性冠脉综合征等疾病[1]。目前关于TanⅡA的药理研究主要集中在心血管方面，关于其他方面的研究较少，因此，难以全面评价Tan ⅡA的药理作用。近年来，基于基因表达谱和Connectivity Map(Cmap)对已上市的药物发现新适应证或新用途，进行重评价、重定用途、重新定位治疗方向，已成为一个新的研究热点。相对于传统的药物研究，基于已知药物的重新定位，不仅能够节省药物研发的时间和成本，而且能够扩大药物的应用范围，并对不同药物的作用机制进行横向对比，是一个不可或缺的药物研究方式[2]。目前已经有学者成功应用Cmap验证了抗菌药小檗碱可以作为组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)抑制剂发挥抗肿瘤作用[3]。这种成功的先例提示可以把这种方法应用在TanⅡA药理作用的评价和研究当中，具体流程见图1。

    图1 研究流程图

    1 资料与方法

    1.1 GEO数据样本获取与预处理

    1.1.1 GEO数据样本获取 从开源数据库GEO(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)中检索与TanⅡA有关的基因芯片，利用R软件的GEOquery包下载GSE85871数据集的CEL格式文件，从中筛选得到GSM2286216、GSM2286217、GSM2286398、GSM2286399共4个MCF7细胞样本的原始基因表达数据。MCF7细胞用MEM/EBSS培养基在37 ℃、5%CO2条件下的培养箱中培养，其中GSM2286216、GSM2286217采用10 μmol/L的TanⅡA处理12 h ......