基于网络药理学和分子对接探讨漏芦防治缺血性脑卒中的作用机制
靶点,通路,1材料与方法,2结果,3讨论
李媛媛,刘珂依,宋 珂,刘浩琦,安 娜,王丽琴,张涵莱,孙逸坤,朱陵群,邢雁伟,高 颖,高永红脑卒中又称“中风”,是全球范围内最主要的威胁人类生命健康的疾病之一,具有高发病率、高致残率和高死亡率的临床特点[1]。缺血性脑卒中是中风最常见的一种疾病类型,约占中风病人总数的87%,主要是由于局部供血障碍导致大脑缺氧性病变和缺血性坏死,进而引发局灶或完全性神经功能缺损[2-3]。目前缺血性脑卒中最有效的治疗策略是溶栓疗法,但由于受时间窗限制且存在出血性转化等影响,临床使用率相对较低[4-5]。因此,如何预防缺血性脑卒中的发生发展,改善脑卒中病人的预后及生活质量,已成为目前临床关注的热点之一。漏芦为菊科植物祁州漏芦的干燥根,主要分布于我国华北、东北和西北诸省,具有清热解毒、消痈下乳、祛瘀通脉之功效[6]。早在《神农本草经》中就有关于漏芦的记载,“漏芦,味苦咸寒,久服轻身益气,耳目聪明,不老延年,列为上品”[7]。现代研究发现,漏芦具有抗氧化、抗缺氧、抗炎、抗动脉粥样硬化以及改善记忆障碍等作用[8],可通过抑制炎症反应,清除氧自由基以及兴奋性氨基酸等毒性物质,发挥防治缺血性脑卒中的作用[9]。但漏芦防治缺血性脑卒中具体作用机制尚不清楚,本研究基于网络药理学构建“药物-有效成分-潜在靶点-通路-疾病”的一种复杂网络调控图,进一步阐释漏芦防治缺血性脑卒中的生物学机制,并利用分子对接技术验证漏芦有效活性成分与其靶点蛋白的亲和性,为深入探讨漏芦防治缺血性脑卒中的分子作用机制提供了一定的研究基础和理论依据。
1 材料与方法
1.1 数据库和软件 本研究涉及的数据库有TCMSP(https://tcmspw.com/tcmsp.php),ETCM(http://www.tcmip.cn/ETCM/),Swiss Target Prediction(http://swisstargetprediction.ch/),SymMap(https://www.symmap.org/),CTD(http://ctdbase.org/),Uniprot(https://www.uniprot.org/),DisGeNET(https://www.disgenet.org/),TTD(http://db.idrblab.net/ttd/),Drugbank(https://www.drugbank.ca/),String(https://string-db.org/cgi/input.pl),Venny 2.1.0(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/) ......
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