基于GEO数据库芯片筛选冠心病标志物及生物信息学分析
差异基因,通路,1资料与方法,2结果,3讨论
李 雪,冯彦超,牟华明,乐 暾冠心病是指冠状动脉粥样硬化引起冠状动脉狭窄或闭塞,导致心肌缺血缺氧或心脏坏死,通过各种作用机制导致一系列不良后果,甚至出现心脏性猝死。目前,冠心病已严重威胁到中老年人群的健康[1]。近年来,基因表达谱数据快速增长,利用生物信息学方法对基因表达谱数据进行深入挖掘成为新的研究热点,既往对冠心病的基因研究多聚集在微小RNAs(microRNAs)上,已有研究证实,冠心病的病理生理过程与microRNAs密切相关[2],但对冠心病病人表达的其他基因认识不足且其他基因是否为冠心病的新型治疗靶点研究较少。本研究使用GEO数据库寻找冠心病病人相关基因芯片、绘制Venn图寻找共同表达的差异基因,运用京都基因与基因组百科全书(KEGG)、STRING等数据库寻找共同差异表达基因之间的联系,进一步寻找冠心病的特征性基因,以期为冠心病早期诊断及特异性靶向治疗提供依据。
1 资料与方法
进入GEO数据库(www.ncbi.nlm.nih.gov/geo),在输入框中输入“coronary disease” AND “coronary heart disease”,检索现有的冠心病基因芯片数据集,获取两个数据集GSE71226、GSE98583 ......
您现在查看是摘要页,全文长 5027 字符。