基于网络药理学和分子对接技术探讨三七治疗心房颤动的分子生物学机制
蛋白激酶,靶点,1资料与方法,2结果,3讨论
陶诗怡,于林童,朱春临,张 瑾,张兰鑫,黄 力心房颤动是临床上最常见的持续性心律失常,是由心房肌纤维相互独立除极而导致的无序激动和无效收缩的房性节律,以心房基质重构和电重构为关键病理机制,其患病率随年龄增长而增加,可诱发栓塞、脑卒中等并发症,具有极高的致残率和致死率[1]。传统西医治疗以抗心律失常药物和电复律为主,但研究表明心房颤动复发率仍处于40%~50%的较高水平[2],而中医药在防治心房颤动方面发挥了积极作用并展现出巨大潜力,因此,进一步挖掘中药抗心房颤动的分子机制不仅有利于研发新药新方,也有助于推动中医药现代化发展。中医古籍中无心房颤动病名的记载,根据临床表现可将其归属于“心悸”“怔忡”范畴,心脉瘀阻证是临床常见证型之一。三七是五加科植物三七Panax notoginseng(Burk.)F.H.Chen的干燥根和根茎,性温,味甘、微苦,归肝、胃经,具有散瘀止血、消肿定痛的功效[3],现代药理研究证实三七具有抗心律失常、抗动脉粥样硬化、扩张血管、降低心肌耗氧量等作用[4],但其治疗心房颤动的具体分子生物学机制尚未见明显立论。
网络药理学是基于系统生物学理论,利用生物网络数据库、生物网络构建方法和生物网络分析技术,通过构建“药物-靶点-疾病”复杂网络,从分子层面分析药物、靶点、疾病之间的内在联系,从而揭示其潜在机制的一门交叉学科[5]。故本研究立足于中药网络药理学,在现代研究充实的基础上对三七治疗心房颤动的分子机制进行预测和总结,以期为后续深入研究提供科学依据。
1 资料与方法
1.1 三七活性成分、靶点收集及网络构建 以“三七”为关键词,通过检索中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库(http://tcmspw.com/tcmsp.php)收集三七活性成分与作用靶点。根据药代动力学(ADME)属性值的推荐筛选标准,以口服利用度(oral bioavailability,OB)≥30%、类药性(drug-likeness,DL)≥0.18为筛选阈值[6-7],获得可纳入研究的活性成分,并通过检索已发表文献对成分进行补充。利用PubChem数据库[8](https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)对活性成分名称、结构式、分子式及CAS号进行校订确认,并借助Uniprot数据库[9](https://www.uniprot.org/)进行靶蛋白基因名的转换。通过Cystoscape 3.7.2软件构建三七活性成分-预测靶点网络。
1.2 心房颤动相关靶点预测 以“atrial fibrillation”为关键词 ......
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