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编号:209421
基于网络药理学和分子对接技术探讨参附注射液治疗休克的分子机制
http://www.100md.com 2022年1月7日 中西医结合心脑血管病杂志 2021年第24期
靶点,1资料与方法,2结果,3讨论
     董 妍,马晓昌,于盼盼,李 春,施保柱

    参附注射液作为传统方剂参附汤的现代用药形式,最早见于宋代严用和的《济生方》,参附注射液是由红参、附片提取制成的中药注射剂,主要治疗阳气暴脱的厥脱症(感染性休克、心源性休克、低容量性休克等),也可用于阳虚(气虚)所致的惊悸、怔忡、喘咳、胃疼、泄泻、痹症等[1]。现代药理研究发现,参附注射液可提高组织氧摄取和氧利用,改善血流动力学,但作用机制未明确[2-3]。网络药理学结合了系统生物学、多向药理学、计算生物学、网络分析等多学科技术和内容,从多靶点研究角度出发,实现药物作用综合网络分析,其整体性、系统性特点与中药及方剂的多成分、多途径、多靶点协同作用的原理一致[4]。本研究基于网络药理学和分子对接探讨参附注射液治疗休克的分子机制。

    1 资料与方法

    1.1 参附注射液相关靶点筛选 通过中医药系统药理学平台[5](TCMSP,https://tcmspw.com/tcmsp.php)寻找2味中药化学组成成分,根据口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%且类药性(drug-likeness,DL)≥0.18的2个药代动力学(ADME)属性值进行活性成分的初步筛选以获得活性化合物及其作用的蛋白质靶点,并根据已发表的文献报道补充未预测到的活性化合物的已知靶点。筛选结束后,作为标准化蛋白质靶点信息,统一在UniProt蛋白质数据库(https://www.uniprot.org)将化合物作用的蛋白质靶点进行规范。

    1.2 休克相关靶点筛选 以“shock”“circulation shock”“休克”为关键词,挖掘基因数据库(GeneCards,https://www.genecards.org)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM,http://www.omim.org)、治疗靶点数据库(TTD,http://bidd.nus.edu.sg/group/cjttd)中治疗休克的潜在靶点,合并3个数据库疾病靶点后,删除重复数值得到休克相关的靶点。

    1.3 参附注射液-休克成分靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络构建 为明确参附注射液相关靶点与休克靶点间的相互作用,采用Cytoscape 3.7.1软件功能构建PPI,并整合提取其交集网络进行拓扑结构分析。以网络节点中的拓扑结构特征值“连接度(degree)”为指标,选择大于其中位数2倍以上的节点作为关键候选靶点;提取分析这些候选节点网络关系,计算每个节点的“连接度”“介度(betweenness)”“紧密度(closeness)”“最近公共祖先(LAC)”“邻域连接度(nighborhood connectivity)” ......

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