基于网络药理学和实验探讨半夏-陈皮药对治疗卒中后抑郁的作用机制
靶点,1资料与方法,2结果,3讨论
徐春悦,冀旭艳,卫 治,李宝玲卒中后抑郁(post-stroke depression,PSD)是脑卒中常见的并发症之一[1]。有研究表明,约33.33%的中风幸存者受卒中后抑郁的影响,导致卒中后抑郁病人自杀率较高[2]。目前的治疗药物存在价格昂贵、副作用显著等不足。因此,迫切需要寻找经济有效的中医药方法治疗卒中后抑郁。本课题组前期临床研究及动物实验均证实,疏脑解郁汤治疗卒中后抑郁有较好的疗效[3-4]。由于中药复方多成分、多靶点的调节作用,因此,疏脑解郁汤治疗卒中后抑郁的作用机制尚未明确。疏脑解郁汤是李宝玲主任针对卒中后抑郁病人气郁、痰阻、血瘀病机,临床应用多年的经验方,半夏-陈皮是疏脑解郁汤中理气化痰的代表药对。本研究基于网络药理学结合实验充分挖掘疏脑解郁汤中半夏-陈皮药对在分子水平多成分、多靶点对卒中后抑郁的整体调节作用,为疏脑解郁汤的实验研究及临床合理应用提供理论依据。
1 资料与方法
1.1 半夏、陈皮有效成分的收集与筛选 通过中医药系统药理学平台(TCMSP,https://tcmsp-e.com/)分别检索半夏、陈皮的化合物成分,并根据药物代谢动力学进行筛选,初步筛选出活性化合物及其作用的蛋白质靶点。筛选标准为口服生物利用度(OB)≥30%且类药性(DL)≥0.18。筛选结束后,统一在蛋白质数据库(UniProt,https://www.uniprot.org)将蛋白质靶点信息进行标准化,并参照文献报道补充未预测到的蛋白质靶点信息。
1.2 卒中后抑郁相关靶点筛选 在人类基因数据库(GeneCards,https://www.genecards.org/)、OMIM数据库(http://www.omim.org)中以“post-stroke depression”“post stroke depression”为关键词进行检索,在DrugBank数据库(https://www.drugbank.ca)进行靶点补充。合并所有检索结果,删除重复值得到疾病靶点。
1.3 “药物-活性成分-靶点”网络构建 将卒中后抑郁的靶点基因与半夏-陈皮成分靶点通过韦恩图获得半夏、陈皮主要活性成分作用于卒中后抑郁的预测靶点,利用Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-靶点”网络。
1.4 蛋白-蛋白互作(PPI)网络构建与分析 将筛选获得的潜在作用靶点输入STRING平台(https://string-db.org/),设置种属为“Homo Sapiens”(人类),相互作用阈值设定为“highest confidence”(>0.9),其余设置为默认值,得到PPI网络,并通过Cytoscape 3.8.2中的MCODE插件对PPI网络进一步分析,得到潜在的蛋白质功能模块 ......
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