基于网络药理学与分子对接探讨失笑散治疗冠心病的作用机制
五灵脂,网络图,靶点,1资料与方法,2结果,3讨论
邵 鑫,朱云鹏,王 彦冠状动脉粥样硬化性心脏病简称冠心病,是由于冠状动脉粥样硬化引起管腔狭窄、阻塞或痉挛,导致心肌缺血、缺氧引起的心脏病[1],是临床常见的心血管疾病之一。中医学将冠心病归属于“胸痹”“真心痛”“心悸”等范畴,相关研究证实中成药在缓解心绞痛、防治再灌注后无复流、心肌梗死二级预防及提高生活质量等方面有独特的优势[2]。
失笑散源自宋代《太平惠民和剂局方》,由蒲黄和五灵脂等组成[3],具有活血祛瘀、散结止痛之效,主治瘀血内停、脉道阻滞所致之痛症。现代药理学研究显示,失笑散具有抗心肌缺血缺氧、抗动脉粥样硬化、抗凝、降压、降脂、镇痛等作用[4-6]。中药复方治疗具有多成分、多靶点、多途径的特性,但其治疗冠心病的潜在作用机制尚未明确。网络药理学是以系统生物学理论为基础,融合了药理学等多学科的内容和技术以阐明药物的作用机制,其整体性、系统性及注重药物成分间相互作用的特性与中医治疗疾病的基本观念相符,可为优化和评价中药复方的临床疗效提供参考依据[7-8]。本研究通过网络药理学“多成分-多靶点-多通路”的分析优势结合分子对接技术探讨失笑散治疗冠心病的潜在作用机制。
1 资料与方法
1.1 失笑散活性成分及作用靶点的筛选 基于中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP,https://tcmspw.com/tcmsp.php/)检索蒲黄的化学成分,以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为条件筛选出蒲黄的有效活性成分,进一步通过TCMSP数据库检索蒲黄活性成分对应的潜在靶点信息,去除不含有靶点的活性成分。利用BATMAN-TCM数据库(http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/)检索五灵脂的活性成分及作用靶点,设置Score cutoff≥39、P≤0.05进行筛选。借助HERB数据库(http://drug.ac.cn/)搜索五灵脂的活性成分,结合BATMAN-TCM数据库查询靶点以具有对应潜在靶点及OB(≥30%)为限进行补充。利用UniProt蛋白质数据库(https://www.uniprot.org/)设置“Reviewed”,且物种为“Human”,查询潜在靶点对应的基因名并进一步规范,将蒲黄和五灵脂的潜在靶点合并去重。
1.2 构建药物-活性成分-潜在靶点网络图 将整理后的药物、活性成分、潜在靶点信息导入Cytoscape 3.9.0软件中进行可视化分析。利用“源节点(source node)”表示药物和活性成分,“边(dege)”表示节点之间的相互联系,“靶节点(target node)”表示活性成分和潜在靶点,从而构建药物-活性成分-潜在靶点网络图 ......
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