孙琳洁,陈 昕,俞佳利,李屹龙,薛金贵

    心血管疾病是当前严重危害人类健康的疾病之一。动脉粥样硬化(AS)主要累及大、中动脉,导致脂质沉积、内膜纤维化,同时粥样斑块引起管壁变硬、管腔狭窄,导致心血管不良事件的发生,其发生发展是多个危险因素共同作用的结果,目前认为其主要与炎症反应、血脂代谢异常及内皮细胞损伤等因素有关[1-2]。益气活血化痰方由黄芪、丹参、全瓜蒌、水蛭、黄连组成,具有抑制炎症反应、调节血脂代谢、稳定粥样斑块等功效,从而降低心血管不良事件的发生风险[3-8]。本研究利用网络药理学的方法,对益气活血化痰方进行分析,探讨其抗AS的可能机制。

    1 资料与方法

    1.1 收集益气活血化痰方活性成分及相关靶点

    基于中药系统药理学数据库分析平台(https://www.tcmsp.e.com/,TCMSP)筛选益气活血化痰方的有效成分,其中黄芪、丹参、全瓜蒌、黄连以口服生物利用度(OB)>30%、类药性(DL)>0.18为条件筛选有效成分。同时,收集文献资料整理水蛭的化学成分,并通过检索有机小分子生物活性数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/,PubChem)获得各成分的化学结构,其中未被PubChem平台收录的成分则利用ChemDraw软件绘制其化学结构,最终将所有化学结构的sdf格式文件上传至瑞士毒药物动力学数据库(http://www.swissadme.ch/,SwissADME)获取活性成分。筛选条件:胃肠道吸收力(GI absorption)为High,类药效(Druglikeness)的Lipinski、Ghose、Veber、Egan、Muegge 5种规则中至少符合2项。在PubChem数据库中,物种选择“homo sapiens”,获取益气活血化痰方中有效成分的简化分子线性输入规范(SMILES),并导入瑞士靶点预测数据库(http://swisstargetsprediction.ch/,Swiss targets Prediction),以“probability>0”为条件获取所有潜在靶点。

    1.2 获取AS靶点与筛选共同靶点

    在基因名片数据库(https://www.genecards.org/,GeneCard)中获取AS基因,根据相关度(relevance score)进行由大到小的排序,以第三四分位数为条件进行筛选获得基因靶点,通过韦恩Venny 2.1(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html)绘制韦恩图,获得益气活血化痰方与AS的共同靶点 ......