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编号:146647
基于网络药理学和分子对接技术探讨蔓荆子防治急性心肌梗死的作用机制
http://www.100md.com 2023年11月21日 中西医结合心脑血管病杂志 2023年第21期
草素,木犀,1资料与方法,1蔓荆子有效成分及其靶点获取,2AMI疾病靶点收集,3药物-药物化合物-靶点网络图的构建,4蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图的构建,5基因本体(geneontolog
     陈礼琴,徐彤彤,吕祥威,武 琦,覃秋语,赵位昆

    急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)是一种常见的心血管疾病,其主要特征是冠状动脉闭塞后心肌长时间处于缺血状态进而导致心肌细胞发生不可逆性损伤[1]。早期及时的血运重建是目前治疗AMI的主要措施,通常采用经皮冠状动脉介入术或溶栓治疗,这些治疗方法能够迅速恢复血供,但是经再灌注治疗后AMI病人的死亡率仍居高不下[2]。因此,积极研发防治AMI的有效治疗药物具有非常重要的意义。

    近年来,随着中医学多靶点、全方位的治疗理念不断推进,中药在心血管领域的重要性不断提升。单纯西药干预治疗存在一定不良反应且治疗效果有限。中药不同于西药,具有多靶点、多通路、多环节的治疗特点,其副作用也相对较轻。蔓荆子是马鞭草科牡荆属植物的干燥成熟果实,具有抗炎、抗菌、抗氧化等药理活性[3]。其成分中含有牡荆子黄酮,即紫花牡荆素,经研究表明,紫花牡荆素可通过多种途径抑制心肌缺血再灌注损伤,对心血管系统疾病有一定的治疗作用,其作用机制可能与抑制炎症反应、氧化反应、细胞凋亡等相关[4]。但是蔓荆子在AMI中的作用尚不清楚,故本研究拟通过网络药理学结合分子对接探讨蔓荆子防治AMI的潜在靶点以及作用机制。

    1 资料与方法

    1.1 蔓荆子有效成分及其靶点获取

    应用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP,https://tcmsp-e.com/tcmsp.php),以草本名称(herb name)“蔓荆子”进行检索,限定口服利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥18%筛选有效成分并通过TCMSP数据库获得相应化合物对应的靶点。满足筛选条件但是未能在TCMSP数据库获得相应作用靶点的化合物,搜索其CAS号并输入PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)以获取其Canonical SMILES号。通过SwissTargetPrediction平台(http://www.swisstargetprediction.ch),物种选择为“Homo sapiens”,将预测出的靶点取Probability>0的前15位作为补充。应用UniPort数据库(https://www.uniprot.org),以物种为人类且为已验证的基因作为筛选条件,对预测的药物靶点名称进行校正,统一为GeneSymbol ......

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