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编号:619915
基于网络药理学和分子对接探讨珠子参地上部分防治脂肪肝的作用机制
http://www.100md.com 2021年7月3日 中南药学 2021年第5期
靶点,通路,1材料与方法,1网络药理学,2动物实验验证,2结果,1珠子参地上部分活性成分及其靶点筛选,2脂肪肝相关疾病靶点的筛选,3“药物-成分-疾病-靶点”网络的构建和分析,4关键靶点PPI网络
     郭敏,贺依依,徐虹,姜祎*,张化为,杨新杰,黄文丽,邓翀,许洪波,王薇*,宋小妹(.陕西中医药大学药学院,陕西 咸阳 7046;.陕西省中药资源产业化协同创新中心、陕西省创新药物研究中心,陕西 咸阳 7046)

    脂肪肝是由多种疾病和原因引起的肝脏脂肪性变[1],可进一步发展为脂肪性肝炎、肝硬化、肝癌,而且脂肪肝是冠心病的易患因素之一[2]。由于其发病率不断增加,已经成为一种严重威胁人类健康的高发疾病[3-4]。

    珠子参为五加科植物珠子参Panax japonicusC.A.Mey.var.major(Burk.)C.Y.Wu et K.M.Feng或羽叶三七Panax japonicusC.A.Mey.var.bipinnatifidus(Seem.)C.Y.Wu et K.M.Feng的干燥根茎[5],主要分布在陕西、甘肃、宁夏、河南、湖南、湖北、四川、云南、西藏等地[6]。珠子参的化学成分多样,主要包括三萜及其皂苷类、挥发油类、甾体及其皂苷类、黄酮类及微量元素等[7],其中,珠子参的皂苷类化学成分表现出较强的抗肿瘤活性[8]和抗肝损伤作用[9]。珠子参的地上部分称为“参叶”“汉中参叶”,局部地区仅将其作为茶叶饮用,利用率低。珠子参可通过抑制c-Jun氨基末端激酶(JNK)和C/EBP同源蛋白(CHOP)的表达来抑制高脂饮食模型组大鼠的肝细胞凋亡,对高脂饮食诱发的肝损伤具有一定保护作用[10]。本研究拟对珠子参地上部分防治脂肪肝的有效成分以及相关作用机制进行探讨。

    本研究遵循网络药理学理论与技术[11],筛选珠子参地上部分活性成分及潜在靶点,通过构建活性成分和靶标(C-T)、靶标和疾病(T-D)网络图,并进行GO功能和KEGG通路的富集分析以及分子对接验证,通过实验验证珠子参地上部分对环氧合酶2(PTGS2)、丝裂原激活的蛋白激酶3(MAPK3)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)的影响,以期从分子层面初步探讨珠子参地上部分防治脂肪肝的可能作用机制,为后续深入研究珠子参地上部分防治脂肪肝作用提供参考依据。

    1 材料与方法

    1.1 网络药理学

    1.1.1 数据库及软件 TCMSP数据库(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php);Swiss TargetPrediction数据库(http://www.swisstargetprediction.ch/);Uniprot数据库(https://www.uniprot.org);Genecards数据库(https://genecards.weizmann.ac.il/v3/);Cytoscape 3.2.1软件;功能蛋白联系网络(String)数据库(https://string-db.org/);R project软件;Autodock_vina 软件(http://vina.scripps.edu/);Protein Data Bank数据库(PDB https://www.rcsb.org/);运行环境 Microsoft Windows 10 Home Basic操作系统 ......

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