四物汤防治动脉粥样硬化分子机制的网络药理学研究及实验验证
靶点,化合物,1方法,1网络药理分析方法,2体外实验方法,2结果,1网络药理分析结果,2体外实验结果,3讨论,1四物汤防治AS可能涉及的主要活性化合物,2四物汤防治AS预测靶点的富集分析,3四物汤防治A
张盟,孙丽萍,高文雅,赵丕文*(. 北京中医药大学 生命科学学院,北京 0488;. 北京中医药大学 中医学院,北京 0488)根据世界卫生组织的相关统计,心血管疾病(cardiovascular diseases,CVDs)在近几十年内已发展成为导致人类死亡的主要原因之一。动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)是心肌梗死及脑卒中等心血管疾病的根本原因,典型特征是动脉壁上的AS斑块,在冠状动脉网络、脑、外周动脉有不同程度的临床表现,是心血管疾病发生的基础[1]。
四物汤由熟地、当归、白芍、川芎四味中药组成[2]。中医学既往并无AS对应病名记载,依据致病特点及临床表现。AS归属于中医学“脉痹、眩晕、胸痹心痛、中风、头痛”等病症范畴,主要证候为痰瘀互结证、气虚血瘀证等,针对不同证型AS的主要治疗药物中,多数都包括了四物汤中的几味药物[3]。
为了能够更加深入、全面地探讨四物汤防治AS作用的分子机制,本研究首先采用网络药理学结合GEO数据库挖掘,对其可能发挥作用的途径和靶点进行探究;在此基础上,应用血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cells,VSMCs)进行四物汤防治AS相关分子机制的体外实验验证。
1 方法
1.1 网络药理分析方法
1.1.1 四物汤中主要活性化合物的筛选与对应靶点的收集 采用TCMSP平台(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)以类药性(drug-like property,DL)>0.18,口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%为条件筛选主要活性化合物[4]。在Pubchem(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov)网站中获取目标化合物SDF结构图,将该结构图导入Swisstarget平台(http://swisstargetprediction.ch/)[5-6],对目标化合物相关靶点进行预测,以可能性Probability>0.2筛选靶点,通过Cytoscape 3.8.0构建“四物汤-单味药-化合物-靶点”的网络[7]。
1.1.2 AS相关靶点的收集 以AS为关键词,在DrugBank(https://www.drugbank.com/)与OMIM数据库(https://www.omim.org/)中搜索该疾病相关靶点。在GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)中搜索AS疾病相关基因表达数据集;筛选目标数据集所测样本有>10个样本数量的AS斑块组织 ......
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