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编号:619635
健康青年人肠道菌群的分布特征研究
http://www.100md.com 2021年12月30日 中南药学 2021年第11期
聚类,人群,1数据获得,1样本来源,2纳入及排除标准,3肠道菌群数据的收集与整理,2方法及原理,1肠道菌群定性数据的聚类分析方法,2聚类分析结果差异菌的筛选,3基于差异菌的数据建立人群分类模型方法,4模型评价指标,3结果与讨论
     田学梅,王慧,梁静宣,王耘(北京中医药大学中药信息工程研究中心,北京 102488)

    人类肠道内存在大量的微生物,在参与维持正常生理过程的同时,与疾病的发生发展也息息相关[1]。肠道微生物不仅可以调控肥胖[2],干预多糖和纤维素在体内消化吸收[3],还影响胃肠道疾病如炎症性肠病、心血管疾病如高血压、代谢类疾病如肥胖、自身免疫性疾病等[4-6]。微生物组菌群结构的变化与人类健康和疾病的发生发展密切相关,利用肠道菌群的分布差异进行个体疾病、健康等的相关研究已逐渐增多。例如2型糖尿病患者与健康个体相比,其肠道内双歧杆菌数量减少[7],胆汁淤积性肝病患者与健康对照者相比,肠道菌群存在特征性改变,韦荣氏球菌属(Veillonella)相对高丰度表达与胆汁淤积性肝病强相关[8]等。肠道菌群的状态会以各种方式反馈给宿主[9],健康个体在不同生活方式、药物、饮食、疾病状态、地域以及年龄阶段,其肠道菌群的分布存在很大差异[10-11]。通过研究不同健康人的肠道菌群的分布特征,调理肠道菌群的状态以改善健康状况。因此是否可以利用不同健康人群间肠道菌群的分布差异对健康人群进行分类,以此来评价个体健康状态并对个体健康进行有效精准的健康管理呢?基于以上思考,本研究利用16S rRNA技术[12]获得的肠道菌群种层面相对丰度数据并转换为定性数据,聚类分析将健康青年人群进行分类,根据不同分类的健康青年人群间的差异菌通过数据挖掘方法[13-14],建立以不同健康青年人分类间肠道菌群的分布差异为指标的健康青年人群分类模型,并探讨不同分类的健康青年人肠道菌群分布特征。以期为青年个性化的健康管理研究奠定基础。

    1 数据获得

    1.1 样本来源

    选择就读于北京中医药大学大一、大二的本科生4000人,随机抽样后共纳入研究对象114人,男女性别比例1∶1,年龄18~22岁。研究经学校伦理委员会批准通过,所有研究对象均了解并签署项目知情同意书。

    1.2 纳入及排除标准

    纳入标准:健康大学生且正常饮食无明显饮食偏颇情况。排除标准:① 患有溃疡性结肠炎、克罗恩病等炎症性肠病及慢性便秘、慢性腹泻等其他肠道疾病患者;② 使用抗菌药物、进行阑尾手术等的患者;③ 合并急性冠脉综合征、急性脑血管意外等危急重症者;④ 有严重情绪或精神异常而无法配合者;⑤ 重大疾病患者。

    1.3 肠道菌群数据的收集与整理

    受试者均无严重疾病,入组后前一个月避免抗菌药物、胃肠道药物等使用并正常饮食,取受试者的早餐前粪样 ......

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