甘肃黄芪种植区根际土壤固氮细菌群落结构特征及多样性考察
1材料与方法,1样本收集,2DNA抽提和PCR扩增,3IlluminaMiseq测序,4数据处理,2结果与分析,1序列统计和微生物多样性分析,2土壤细菌群落结构分析,3固氮菌群落的相关性分析,4基于种水平
牟建平,滕宝霞*,史中飞,马尚贤,贺晓文,赖晶,朱玲,肖静,曾小梅(1.甘肃省药品检验研究院,兰州 70060;2.国家药监局中药材及饮片质量控制重点实验室,兰州 70060;.广河县人民医院,甘肃 临夏 7100)黄芪在我国广泛种植使用,多数中成药以黄芪作为君药。《中国药典》2020年版一部收载黄芪为豆科植物蒙古黄芪
Astragalus membranaceus
(Fisch.)Bge.var.
mongholicus
(Bge.)Hsiao或膜荚黄芪
Astragalus membranaceus
(Fisch.)Bge.的干燥根。黄芪药材的质量不仅与药材的基因型有关,还会受到特定生态环境的影响,根际微生物群落在植物和土壤之间发挥着重要作用,良好的根际微生物多样性能够维持土壤微生态的平衡,保证植株正常生长,土壤微生物作为评估土壤生态系统的重要指标,对植物生长具有重要意义。近年来对药用植物与根际微生物关系的研究得到了高度重视,不仅有助于分析并阐明药用植物与根际有益微生物及有害微生物相互作用的机制等基础理论,而且也有助于解决药用植物病害防治、连作障碍等生产实际问题,从而提高药用植物的产量和品质。本文基于高通量测序技术,测定了甘肃6个黄芪产区的黄芪根际土壤固氮菌多样性,分析根际土壤固氮菌群落结构和组成,为进一步分析根际固氮菌种群结构影响土壤养分释放和黄芪生长提供资料。1 材料与方法
1.1 样本收集
选择甘肃省陇西县、漳县、靖远县、渭源县、通渭县和宕昌县6个黄芪广泛的种植区,均为蒙古黄芪,于黄芪开花生长时期,收集其根际土壤,先挖出根系,抖掉与根系松散结合的土壤,将与根系结合的土壤使用无菌刷子刷下来作为根际土壤,装入无菌封口袋,标记,采样信息见表1。
表1 样品采集信息
Tab 1 Sample collection information
样品编号 采集地点 经度 纬度 海拔/m LX 陇西县菜子镇 104° 28' 14'' 35° 8' 42'' 2153 ZX 漳县殪虎桥镇 104° 15' 6'' 34° 47' 42'' 2269 JY 靖远县北湾镇 104° 38' 42'' 36° 34' 44'' 1373 WY 渭源县会川镇 103° 58' 37'' 35° 7' 11'' 2235 TW 通渭县陇山镇 105° 40' 68'' 35° 29' 8'' 1986 TC 宕昌县南阳镇 104° 20' 21'' 35° 55' 47'' 2318 ......
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