基于分子连接性指数的高频抗新型冠状病毒肺炎中药物质基础研究
草果,赤芍,苍术,1资料与方法,1资料纳入与排除,2原理,3方法,2结果,1《诊疗方案》中高频抗COVID-19中药各类成分占总成分的比例统计,2《诊疗方案》中高频抗COVID-19中药所含成分MCI
吴月峰,朱志飞,陈定芳,刘有志,袁筱,樊启猛,孟蕾,范习之,周晋*,贺福元*(.湖南中医药大学药学院,长沙 40208;2.中药成药性与制剂制备湖南省重点实验室,长沙 40208;3.中医药超分子机理与数理特征化实验室,长沙 40208;4.中药药性与药效国家中医药管理局重点实验室,长沙 40208)新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndromecoronavirus 2,SARS-CoV-2)引起的急性传染病,主要通过呼吸道传播,人被感染后常出现呼吸道症状、发热、咳嗽、气促和呼吸困难等体征,严重可致死亡,即使是无症状患者同样具有隐蔽的传染能力,且病毒变异迅速,这使得COVID-19在全球快速蔓延。而中药(复方)通过多成分-多靶点-多通路发挥作用,在改善症状、缩短病程、延缓疾病进展和降低病死率等方面体现出明确疗效和独特优势。探寻中药抗COVID-19的物质基础是战胜COVID-19的一种有效手段,值得深入研究。本文旨在通过计算高频抗COVID-19单味中药成分(群)的0~8阶MCI及MCI相似度,筛选潜在的抗COVID-19的有效成分(群),为高频抗COVID-19中药的物质基础研究提供依据。
1 资料与方法
1.1 资料纳入与排除
统计《COVID-19诊疗方案(试行第八版)》(简称《诊疗方案》)中药频次,其中高频中药包括广藿香(7次)、甘草(7次)、生石膏(6次)、苍术(5次)、麻黄(5次)、草果(4次)、厚朴(4次)、苦杏仁(4次)、葶苈子(4次)、茯苓(3次)、赤芍(3次)、生姜(3次)、陈皮(3次),把这13味高频中药纳入资料,排除生石膏(TCMSP库没有收集成分),在中药数据库及分析平台(TCMSP)检索其余12味中药所含成分信息,共检索到1526个成分,剔除372个重复成分后,一共得到1154个成分。
1.2 原理
分子连接性指数(MCI)是一种将成分结构用数值表示的拓扑指数,把MCI与药理活性相关联,可定量描述分子结构信息和分子结构与理化性质、生物活性之间的构效关系,具有分子结构数字化、构效关系定量化、数值可加和性和MCI相似度可识别性(筛选质量标志物)等特点。基于Kier等学者提出的MCI理论,目前团队已有的软件程序可计算到26层级0~8阶MCI。
在前期研究中,本团队通过分析鱼腥草挥发油的气质联用图谱和计算鱼腥草挥发油成分的1阶MCI找寻质量标志物 ......
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