基于网络药理学的健脾清化方治疗2型糖尿病的作用机制研究
靶标,靶点,1材料与方法,1药物成分与靶点筛选方法,2药材-化合物-靶点网络图的构建,32型糖尿病的靶点信息筛选,4潜在作用靶点的获取,5PPI网络的构建,6GO及KEGG靶点通路富集分析,2结果,1药物
唐励静,申利贤,吴广,王梅,李荣南华大学附属第二医院,南华大学衡阳医学院,临床药学科,湖南衡阳 421001
2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)是一种多因素引起具有遗传易感性的内分泌代谢性疾病,主要特征为慢性高血糖。《中国心血管健康与疾病报告2020》[1]报道在2015—2017年,中国成年人糖尿病患病率为11.2%,其中大陆成人患糖尿病人数约为1.298亿。在中医学中,糖尿病有其专属的名称,被称为“消渴病”或糖络病等,并且中医药在治疗糖尿病、防治并发症中有独特的优势和作用,《中国2型糖尿病防治指南(2020年版)》进一步明确了中医药在糖尿病防治中的重要地位和作用[2]。本研究通过网络药理学进一步探讨健脾清化方中有效成分和2型糖尿病的作用靶点及通路,阐述其可能潜在的作用机制,为中医药治疗2型糖尿病提供理论基础与科学依据的支持。现报道如下。
1 材料与方法
1.1 药物成分与靶点筛选方法
通过TCMSP数据库,网站搜索地址为http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php,检索健脾清化方中“山药”“葛根”“黄 芪”“党 参”“黄 芩”“黄 连”“黄 精”“鬼 箭 羽”的化学成分。以口服生物利用度OB≥30%和类药性DL≥0.18为阈值筛选出相应化合物的活性成分,利用TCMSP数据库中的选项Related Targets-对筛选到的活性成分有关的靶点进行预测分析。标准基因名称使用UniProt(http://www.uniprot.org)的数据库筛选有效化合物对应的作用靶点命名。
1.2 药材-化合物-靶点网络图的构建
健脾清化方中有效的化合物信息和作用靶点使用Cytoscape3.7.2软件处理,有效化合物和作用靶点的标示用“节点”表示,用“边”表示二者之间的作用关系。通过网络拓扑学进一步分析,以等级值(Degree)、亲中心度值(closeness centrality)、中介中心度(betweenness centrality)来显示“节点”程度的重 要 性,Betweenness和Degree centrality的 数 值 越大 ......
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