2.1筛选差异表达基因

    用GeneSpring软件对FARSHCHIAN等[4]收集的8个疾病样本和5个正常样本原始数据进行分析，以P<0.05、倍数变化(FC)>2.0为标准筛选差异基因，共筛选出894个差异基因，其中上调基因438个，下调基因456个。前50位上调基因和下调基因用热图表示，见图1。

    2.2GO分析

    GO分析显示上调基因主要富集的生物进程(BP)：有丝分裂细胞周期过程，染色体分离，有丝分裂核分裂；下调基因主要富集的BP：角质形成细胞分化。上调基因主要富集的分子功能(MF)：DNA解旋酶活性，染色质结合，DNA复制起始结合；下调基因主要富集的MF：MAP激酶酪氨酸/丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性，生长因子受体结合，MAP激酶磷酸酶活性。上调基因主要富集的细胞成分(CC)：染色体的一部分，核质，稠密染色体；下调基因主要富集的CC：编码角质化包膜，胞外区，胞囊。见表1。

    2.3KEGG信号通路分析

    得到了上调基因和下调基因富集的主要信号通路，上调基因主要富集的信号通路包括DNA复制、细胞周期、错配修复、蛋白酶体、Fanconi贫血通路；下调基因主要富集的信号通路包括MAPK信号通路、腹背轴的形成、Notch信号通路、精氨酸和脯氨酸代谢、轴突导向。见表2。

    2.4蛋白质PPI分析

    基于STRING数据库筛选出10个最具代表性的枢纽节点如下：Src homology 2 domaincontaining

    3讨论

    cSCC具有转移至人体任何器官的能力 ......