大数据挖掘影响肺腺癌总生存的分子机制(2)
1材料与方法
1.1实验样本信息收集
于TCGA数据库(https://cancergenome.nih.gov/)中收集肺腺癌相关的RNA测序数据(Level 3),筛选所有同时具备肺腺癌组织与癌旁正常组织的测序数据的样本,共58对。
640青岛大学学报(医学版)54卷
收集TCGA数据库中肺腺癌RNA测序数据(Level 3),筛选同时具备微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)及mRNA测序信息的样本,共420例。
1.2独立验证样本信息收集
于GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/)中收集具备生存时间信息的肺腺癌相关mRNA基因芯片数据,共10套,分别为GSE43767、68465、3141、41271、11969、30219、42172、50081、13213、8894。
1.3统计学处理
所有数据均采用R语言(版本号2.15.3)进行分析 ......
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