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编号:13571559
大数据挖掘影响肺腺癌总生存的分子机制(1)
http://www.100md.com 2018年12月1日 《青岛大学学报(医学版)》 20186
大数据挖掘影响肺腺癌总生存的分子机制,肺肿瘤,生存时间,微小染色体维持蛋白类
     [摘要]目的大数据挖掘影响肺腺癌总生存的分子机制。方法分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中肺腺癌RNA测序数据,将肺腺癌样本中上调的mRNA分别在10套GEO基因芯片数据中进行生存分析。应用生物信息分析方法探索微小染色体维持蛋白4(MCM4)基因上游相关的微小RNA(miRNA)以及长链非编码RNA(lncRNA)。结果MCM4 mRNA高表达,在10套独立数据中均可致肺腺癌总生存下降(χ2=4.16~10.70,P<0.05)。与MCM4呈显著线性负相关的miRNA为miR-338-3p(r=-0.379,P<0.01),与MCM4呈显著线性正相关的lncRNA为ENSG00000228801.5(r=0.438,P<0.001)、ENSG00000234129.3(r=0.461,P<0.001)、ENSG00000259758.1(r=0.431 ......
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