1.5 生物信息学分析

    测序得到的原始数据通过barcode分配样品reads，得到每个样本的有效序列。采用Trimmo-matic软件，将测序结果末端低质量的序列去掉，根据PE reads之间的overlap关系，采用flash软件将成对的reads拼接成一条序列。采用mothur软件对序列质量进行质控，将模糊碱基、单碱基高重复区、过长和过短的序列以及PCR过程中产生的一些嵌合体去除，得到优化序列。之后进行OTU(ope-rational taxonomic unit)聚类(UPARSE software)，将OTU代表序列与Silva 128数据库比对进行物种信息注释。基于分类学信息，在门、纲、目、科、属、种分类水平上进行群落结构的统计分析。

    1.6 统计学处理

    采用Graph Pad Prism 6.0软件进行统计学处理，所得计量资料数据以±s表示 ......