1.3 筛选高表达基因

    从paxdb下载金葡菌的49种菌株蛋白表达数据。取最高表达的10%作为潜在的高表达基因[14]。高表达基因20～205个，平均值为185个。

    1.4 挑选必需基因

    从必需基因库DEG数据库下载(http：//www.essentialgene.org/)后挑选出49种金葡菌的菌株必需基因[15]。任取金葡菌菌株N315与金葡菌菌株NCTC交集得到必需基因1(176个)。再推广到金葡菌49种菌株得到共同必需基因170个。由此得到整个金葡菌群的共同必需基因。

    1.5 确定基因组岛基因

    从IslandViewer的网站(http：//www.patho-genomics.sfu.ca/islandviewer/query.php)获取已经测序的基因组岛。从中挑选出金葡菌的基因组岛序列，结合NCBI的同源Blast比对来确定其基因组岛基因32个。

    1.6 寻找新的药靶基因

    同时存在于必需基因与高表达基因的基因能够决定细菌的生存能力，加上基因组岛及预测到的新基因，再排除与人类及肠道菌群相似度高的基因，可以得到最终的药靶基因。最后利用DrugBank数据库(https：//www.drugbank.ca/)的序列检索核查药靶基因的同源临床药物 ......