PT95菌株和6株标准青霉菌株的亲缘关系分析
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摘要：目的分析PT95菌株和6株标准菌株的亲缘关系。方法用RAPD技术分析PT95菌株、4株PT95的突变株和6株标准菌株，并应用SPSS软件构建聚类图。结果PT95菌株均与汤姆青霉系的3种已知标准菌有一定的差异，根据聚类图可清楚地将PT95菌株与其它菌株分开。结论PT95菌株不同于任一汤姆青霉系的已知菌，可能是一新种。
关键词：青霉；DNA；扩增
中图分类号：Q935文献标识码：A文章编号：1672-979X(2007)06-0006-03
Genetic Relationship Analysis of Penicillium sp.PT95 and Six Standard Stains
CUI Li-xia1，HAN Jian-rong2
(1. College of Chemical Engineering and Environment, North University of China, Taiyuan 030051, China; 2. School of Life Science and Technology, Shanxi University, Taiyuan 030006, China)
Abstract：Objective To analyze the genetic relationship of Penicillium sp.PT95 and six standard stains. Methods Strains of Penicillium, i.e. PT95 and its 4 mutants as well as 6 standard strains had been analyzed by using RAPD, and the dendrogram was produced by SPSS. Results PT95 strain differed from all standard strains of P. thomii series. According to the dendrogram, PT95 strain could be obviously distinguished from other strains. ConclusionPT95 strain is not any species known of P. thomii series and probably is a new species.
Key words：Penicillium sp.; DNA; amplification
青霉PT95是一株能在菌核内积累类胡萝卜素的菌株，因它有单轮型帚状枝，已将其鉴定到汤姆青霉系(P. thomii series)[1]。本实验用随机扩增多态性DNA技术分析了PT95菌株和汤姆青霉系的几株标准菌株及其它青霉菌株之间的亲缘关系。
随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA，RAPD)是以PCR 为基础，利用人工合成的约10 bp的随机序列寡核苷酸作引物，以生物基因组DNA为模板进行PCR扩增产生不连续的DNA产物，用琼脂糖凝胶电泳检测DNA序列多态性的一种技术。RAPD用于青霉的鉴定和多态性分析方面国内报道较少。吴易等[2]对12株马内菲青霉(P. marneffei)进行DNA指纹图谱分析，认为RAPD技术可用于马内菲青霉基因的分型；Geisen等[3]用不同的引物对P. roqueforti进行基因型分析，认为RAPD分析与生理生化分析的结果是一致的；Bogs 等[4]应用此技术分析产生赭曲霉素的P. verrucosum 和 P. nordicum ，发现聚类结果与产生的次生代谢物之间是互相联系的。由此认为对青霉进行RAPD分析是研究菌种亲缘关系的有效途径。
1仪器与材料
1.1仪器
DYY-Ⅲ5型稳压稳流电泳仪、DYCP-31DN型电泳槽(北京六一仪器厂)；MSE微型高速离心机(日本三洋公司)；SW-CJ-1F超净台(苏净集团苏州安泰空气技术有限公司)；HH-B11电热恒温培养箱(上海跃进医疗器械厂)；PCR仪(PTC-200)；凝胶成像系统(GDS：Bioimaging System，Gene，US)。
1.2材料
PCR引物(上海生工生物技术服务有限公司)；dNTP、Taq DNA聚合酶、琼脂糖(上海申友公司)； DNA Marker(片段长度分别为21227，5148，4973，4268，3530，2027，1904，1584，1375，947，831，564，125 bp，华美生物工程公司)。
产黄青霉(P. chrysogenum，编号3.3871)、菌核青霉(P. sclerotirum，编号3.4032)、石状青霉(P. lapidosum，编号3.4353)、娄地青霉(P. roqueforti，编号3.745)、嗜松青霉(P ......
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