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编号:11504751
应用点突变预测程序(SIFT)检查MLH1蛋白质中的结肠癌相关点突变(2)
http://www.100md.com 2007年10月25日 戴 洛 钱 群 江从庆
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    参见附件(170KB,2页)。

     我们考察了Pfam数据库中关于MLH1的信息,我们发现,MLH1的蛋白质序列大致可以分为三段,1~158区域为第一段,包含有一个组氨酸蛋白激酶功能区域;159~335为第二段,包含有一个DNA修复的功能区域;336~756为第三段,包含有两个低复杂性区域和一个未知功能的区域(具体见图1)。突变分析的结果显示严重影响蛋白质功能的突变主要发生在高度保守的组氨酸蛋白激酶功能区域(图1-I);而第三区段含有大量的良性突变说明这个区段包含有丰富的多态性位点。

    临床上对于MLH1和结肠癌的相关性作了大量的分析,但是发现,对于大部分的结肠癌病人,并没有检测到所期望的MLH1错义突变,而在一些罕见家族性的结肠癌患者(如HNPCC)中则可以检测到错义突变[6]。这个现象提示MLH1的错义突变具有遗传性,在结肠癌的发病过程的早期起作用,并且应该和肿瘤的易感性有密切关系。

    当然,突变对蛋白质功能的影响是复杂的,最终还是考虑到突变对蛋白质结构的改变,以及结构和功能的关系。因此,为了获得更准确的突变预测,在今后的研究中需要引入结构生物学的方法。另外,除去本文所考虑的编码区突变外,在基因的非编码区发生的突变对蛋白质的表达等也会产生重要的影响 ......

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