miRNA—181a及其靶基因共济失调—毛细血管扩张突变基因在胃癌组织中的表达及意义(2)
1 对象与方法
1.1 对象
选取2009年4月1日~2011年12月1日广州市第一人民医院外科手术切除的胃癌标本9例,同时选取其癌旁非癌组织标本作为对照。通过病理专家确定所选胃癌标本均为中晚期胃癌,且入选患者术前均未行放、化疗等治疗。配对的癌旁非癌组织取其距胃癌癌灶边缘5 cm以上,术后经液氮速冻保存在-80℃冰箱。本研究经广州市第一人民医院医学伦理委员会通过,所有患者知情同意并签署知情同意书。
1.2 靶基因的预测
运用3个生物信息学预测软件,预测miR-181a的靶基因。MiRanda、PicTar及TargetScan。
1.3 引物设计及合成
在miRNA Base数据库和GeneBank数据库中基因序列的查找,引物设计采用Primer express 2.0软件。内参照U6及miR-181a由丹麦生物工程公司Exiqon设计、合成。
1.4 检测miR-181a
采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)技术 ......
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1.1 对象
选取2009年4月1日~2011年12月1日广州市第一人民医院外科手术切除的胃癌标本9例,同时选取其癌旁非癌组织标本作为对照。通过病理专家确定所选胃癌标本均为中晚期胃癌,且入选患者术前均未行放、化疗等治疗。配对的癌旁非癌组织取其距胃癌癌灶边缘5 cm以上,术后经液氮速冻保存在-80℃冰箱。本研究经广州市第一人民医院医学伦理委员会通过,所有患者知情同意并签署知情同意书。
1.2 靶基因的预测
运用3个生物信息学预测软件,预测miR-181a的靶基因。MiRanda、PicTar及TargetScan。
1.3 引物设计及合成
在miRNA Base数据库和GeneBank数据库中基因序列的查找,引物设计采用Primer express 2.0软件。内参照U6及miR-181a由丹麦生物工程公司Exiqon设计、合成。
1.4 检测miR-181a
采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)技术 ......
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