新疆细粒棘球绦虫EgAgB8/3蛋白的生物信息学分析及意义(1)
[摘要] 目的 分析新疆细粒棘球蚴EgAgB8/3蛋白氨基酸序列,了解该蛋白特性,预测其抗原表位,为进一步研究和选择包虫病免疫学诊断与防治的最佳候选抗原提供理论依据。 方法 利用生物信息学方法推测EgAgB8/3蛋白氨基酸序列及理化性质,用不同的生物信息学软件分析EgAgB8/3蛋白的特性及二级结构,并结合多参数预测其抗原表位。 结果 EgAgB8/3抗原是由75个氨基酸残基组成的多肽,相对分子质量为8.58×103,等电点为8.5;蛋白特性分析显示EgAgB8/3蛋白α螺旋、β折叠、β转角和无规卷曲等二级结构特点,有3个β转角较好区域可作为表位所在参考区段;3种软件多参数综合分析预测,EgAgB8/3蛋白抗原表位集中在1~7(FVVVAHA)、6~19(HADDDDDEVTKTKK)、32~38(FQSDPLG)区段。 结论 运用生物信息学分析方法预测到EgAgB8/3抗原3个B细胞的优势表位 ......
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