1 材料与方法

    1.1 材料

    1.1.1 TCMD

    TCMD[17]是由中科院过程工程研究所分子设计课题组研发的科学数据库产品，本研究所用版本为TCMD2003.1，包括9127个化合物结构及其相关信息。

    1.1.2 分子模拟与分子设计软件包(MOE)

    MOE[18]由加拿大Chemical Computer Group公司開发，本研究使用的版本为MOE2009.10。

    1.2 方法

    1.2.1 构建数据库

    对文献报道的化学合成的3-OH HEPT类HIV RT(NNRTI)/IN双靶点抑制剂进行收集、整理，通过MOE数据库构建模块构建数据库。

    1.2.2 构建药效团模型

    1.2.2.1 构象搜索 在MOE构象搜索模块对化合物1～5进行构象搜索，得到其最低能量构象。参数设置如下：搜索策略选择LowModeMD；构象能量截断值(cutoff)设定为7 kcal/mol，即能量大于E-min+cutoff(E-min是全局极小值)的构象将被删除；RMS梯度(Gradient)为0.005；RMSD限定值为0.25？魡；其他参数保留默认设置 ......