1 材料与方法

    1.1 GEO数据集的获取

    从GEO数据库中搜索与糖尿病肾病相关的基因芯片，从中筛选并下载了基因表达谱数据集，采用GPL571芯片平台。

    1.2 糖尿病肾病的相关差异表达基因分析

    采用R软件对GSE31022芯片中的合格样本进行差异基因的有效分析，具体操作参考d-chip说明[9]，进行显著性分析的P值< 0.05和差异基因倍数≥1.2倍。

    1.3 相关基因集的富集分析

    从NCBI的GEO数据库中获得与糖尿病肾病相关的数据集进行GSEA基因集富集分析。然后从GSEA网站的数据库中选取Canonical pathways、KEGG gene sets、GO gene sets、GO biological process四个基因集作为阳性参照基因集。按照default weighted enrichment statistic的方法重复分析1000次，P < 0.05的通路/过程定义为显著富集分析通路[10]。

    1.4 筛选糖尿病肾病的治疗药物

    通过Cmap数据库进行糖尿病肾病的有效治疗药物的筛选，首先通过R软件进行基因集的富集分析，获得上调或者下调的相关基因，然后将基因名转换成为“Affymetrix gene chip Human GenomeU133A Array”的标准探针 ......